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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)


[交流] 细菌RNA电泳图

请大家帮忙看看我的RNA电泳图,分析下是不是有什么问题啊,感觉5s很亮啊是不是有降解?我刚开始练习提取RNA,不清楚这样的样品能不能做后续实验啊,请高手指教。
1和2是trizol提取后的样品,有少量基因组DNA残留,所以就用了DNaseI消化半小时。3和4是DNaseI作用后的样品电泳。感觉浓度不够,又做了氯仿抽提,结果为5和6。非变性琼脂糖,1%,80V,30min。
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wanghuiyanyx(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+3, 鼓励应助! 2012-03-19 11:48:54
看帖子回复中我跑的电泳http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4233234&authorid=243823

鉴于lz的结果,如果是用来调取基因的话,应该可以继续往下做;但是如果做一些比较精细的实验,建议还是摸索一下实验条件,提高RNA质量以后再继续。

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2楼2012-03-19 11:12:57
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)


送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaohq1209 at 2012-03-19 11:12:57:
看帖子回复中我跑的电泳http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4233234&authorid=243823

鉴于lz的结果,如果是用来调取基因的话,应该可以继续往下做;但是如果做一些比较精细的实验,建议还是摸索一下 ...

请问你是用什么试剂盒提的呢?或者trizol?电泳条件怎样?什么缓冲液啊?我的胶跑的比较糟糕,想看看是不是除了提取过程,电泳是不是也出问题了。

[ Last edited by wanghuiyanyx on 2012-3-20 at 17:39 ]
3楼2012-03-20 17:38:07
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longrna

新虫 (正式写手)



wanghuiyanyx(金币+1): 谢谢参与
RNA质量挺好的。我也提过一些细菌的RNA,有些菌的5S就是特别亮。跟物种有关。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-03-20 18:04:43
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引用回帖:
3楼: Originally posted by wanghuiyanyx at 2012-03-20 17:38:07:
请问你是用什么试剂盒提的呢?或者trizol?电泳条件怎样?什么缓冲液啊?我的胶跑的比较糟糕,想看看是不是除了提取过程,电泳是不是也出问题了。

我用的是qiagen的试剂盒。电压500V 5min左右,TBE buffer。
5楼2012-03-20 21:57:03
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by zhaohq1209 at 2012-03-20 21:57:03:
我用的是qiagen的试剂盒。电压500V 5min左右,TBE buffer。

谢谢。我也用过qiagen的kit,因为它是特异性去除200bp以下的RNA,所以看不到5s。
6楼2012-03-21 09:18:57
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)


送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by longrna at 2012-03-20 18:04:43:
RNA质量挺好的。我也提过一些细菌的RNA,有些菌的5S就是特别亮。跟物种有关。

能提供个电泳图参考不呵呵?我这个菌没找到过别人的RNA电泳图,总担心自己提的太差。
7楼2012-03-21 09:31:50
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