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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 细菌RNA电泳图
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)

[交流] 细菌RNA电泳图

请大家帮忙看看我的RNA电泳图，分析下是不是有什么问题啊，感觉5s很亮啊是不是有降解？我刚开始练习提取RNA，不清楚这样的样品能不能做后续实验啊，请高手指教。
1和2是trizol提取后的样品，有少量基因组DNA残留，所以就用了DNaseI消化半小时。3和4是DNaseI作用后的样品电泳。感觉浓度不够，又做了氯仿抽提，结果为5和6。非变性琼脂糖，1%，80V，30min。
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1楼 2012-03-19 09:52:43
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
wanghuiyanyx(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+3, 鼓励应助！ 2012-03-19 11:48:54
看帖子回复中我跑的电泳http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4233234&authorid=243823

鉴于lz的结果，如果是用来调取基因的话，应该可以继续往下做；但是如果做一些比较精细的实验，建议还是摸索一下实验条件，提高RNA质量以后再继续。
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wanghuiyanyx
2楼2012-03-19 11:12:57
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaohq1209 at 2012-03-19 11:12:57:
看帖子回复中我跑的电泳http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4233234&authorid=243823

鉴于lz的结果，如果是用来调取基因的话，应该可以继续往下做；但是如果做一些比较精细的实验，建议还是摸索一下 ...

请问你是用什么试剂盒提的呢？或者trizol？电泳条件怎样？什么缓冲液啊？我的胶跑的比较糟糕，想看看是不是除了提取过程，电泳是不是也出问题了。

[ Last edited by wanghuiyanyx on 2012-3-20 at 17:39 ]
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3楼2012-03-20 17:38:07
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longrna

新虫 (正式写手)
★
wanghuiyanyx(金币+1): 谢谢参与
RNA质量挺好的。我也提过一些细菌的RNA，有些菌的5S就是特别亮。跟物种有关。
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wanghuiyanyx
4楼2012-03-20 18:04:43
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wanghuiyanyx at 2012-03-20 17:38:07:
请问你是用什么试剂盒提的呢？或者trizol？电泳条件怎样？什么缓冲液啊？我的胶跑的比较糟糕，想看看是不是除了提取过程，电泳是不是也出问题了。

我用的是qiagen的试剂盒。电压500V 5min左右，TBE buffer。
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5楼2012-03-20 21:57:03
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhaohq1209 at 2012-03-20 21:57:03:
我用的是qiagen的试剂盒。电压500V 5min左右，TBE buffer。

谢谢。我也用过qiagen的kit，因为它是特异性去除200bp以下的RNA，所以看不到5s。
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6楼2012-03-21 09:18:57
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wanghuiyanyx

金虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by longrna at 2012-03-20 18:04:43:
RNA质量挺好的。我也提过一些细菌的RNA，有些菌的5S就是特别亮。跟物种有关。

能提供个电泳图参考不呵呵？我这个菌没找到过别人的RNA电泳图，总担心自己提的太差。
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7楼2012-03-21 09:31:50
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