楼: Originally posted by longrna at 2012-02-29 09:16:13:
用于芯片估计对DNA污染要求很高吧？
个人经验：柱上消化效率不如在溶液体系里加DNase I消化。
既然你都提出来RNA了只能再进行DNaseI消化处理一次咯，当然，消化处理后用柱子或氯仿抽提一次即可不必担心纯度及浓 ...

楼: Originally posted by longrna at 2012-02-29 10:50:35:
担心降解可以把RNA沉淀下来再加上无水乙醇进行干冰运输。
其他RNA-seq也没要求必须除尽DNA吧？芯片就不清楚了
氯仿再抽提一次加上去掉的DNA在OD值上估计会损失40-50%。

楼: Originally posted by longrna at 2012-02-29 12:48:06:
我做的RNA-SEQ是取total RNA，然后进行mRNA纯化（通过oligo（dT）的磁珠），所以测的其实是mRNA. 当然，由于受限于特异性，测出来的数据肯定会有核糖体RNA的存在，只占比较少的一定比例。

楼: Originally posted by quiller2000 at 2012-03-08 13:03:30:
你要是做芯片或者做RNA-seq，不需要除gDNA的；qPCR需要除一下



PS，现在做deep-sequencing的同志们真多啊！