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750bp片段克隆已有8人参与
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虫友们大家好! 我就不卖关子了。我最近一直在做PCR,目的片段大约是750bp,体系如下:buffer~2ul,dNTPmix~1.6ul ,引物各0.5ul ,模板(cDNA)~2ul,酶~0.2ul,水~13.2ul,一起是20ul的体系, 酶是takara 的ExTaq, 程序:94 5min, 94 30s, annealing 30s, 72 45s, 35个cycles, 72 5min。 刚开始就按引物合成单上面的退火温度来做,结果只有100bp的引物二聚体,后来做了个温度梯度,结果还只有100bp的引物二聚体。上游引物是参考文献上面的,下游引物是软件设计的,上游引物18bp,下游引物19bp。求高手指导啊!先在此谢过大家了!本人金币不过,忘见谅! |
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17楼2014-11-19 15:56:46
zhaodahe
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guoliwang
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【答案】应助回帖
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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-11-18 22:50:58
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| 如果改变退火温度和其它条件都无效,也许需要换引物。不过觉得你循环数有点多,25到28应该就够了,循环数再多,产物也增加不了太多。模板一般加50ng(0.5ul左右)就不少了,你质粒什么浓度?你可以把模板质粒跑电泳估测浓度,Abs260对过高和过低浓度不准。引物是10uM的吧?别和100uM搞混。还有如果只是一个反应的话,可以把反应体系增加到50ul,否则蒸发一点,再挂壁一点,对反应体系影响大,而且体积太小不好加样,另外产物量也增加了。为获得更多PCR产物,我的经验是增加反应体积比过高提高循环数好。 |

3楼2014-11-18 18:40:27
4楼2014-11-18 18:41:34
zhaodahe
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fuchange918
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