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wawjp

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教一个关于测序结果的问题

年前做了一个测序,结果很奇怪,虽然测序结果是测到了,但是结果和目的片段进行比对,发现测序结果分为两部分,前300正是自己的目的片段,而后300则是目的片段的反向序列,也就是说一个测序结果上出现了两个目的片段,一个正向,一个反向,不知道是怎么一回事,请教各位高手,同时祝大家元宵节快乐
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【分子生物】EPI帖 核酸与基因生物学

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小靳-兰兰

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, MolEPI+1, 条理清楚,简明扼要 2012-06-11 13:45:54
测序要求分四种:(1)正向:测的是DNA正链,模板链 (2)反向:测的是与DNA正链互补的反链 (3)双向:正向、反向都测(4)测通:DNA片段小于750bp时,一个反应就可以测通,对于DNA片段大于750bp时 ,由于受现在技术及仪器条件限制,所以就需要根据已测的序列重新设计和合成引物,接着往下测序。
你的应是双向测序结果,将测序结果做个assemble,拼接,会发现正反两个结果完全重合,即是你目的片段
19楼2012-06-11 00:02:59
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普通回帖

bst5

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+1): 鼓励发帖交流! 2012-02-06 18:15:48
确定你的连接产物大小是对的吗?还有连上的产物是你目的的两倍啊
2楼2012-02-06 11:12:46
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wzqno

金虫 (小有名气)


amisking(金币+1): 鼓励发帖交流! 2012-02-06 18:15:54
你得说清楚你是用的什么载体,TA克隆还是酶切后连的,不然不好分析
3楼2012-02-06 11:27:40
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wawjp

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by bst5 at 2012-02-06 11:12:46:
确定你的连接产物大小是对的吗?还有连上的产物是你目的的两倍啊

应该是没有问题的
4楼2012-02-06 11:41:07
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wawjp

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by wzqno at 2012-02-06 11:27:40:
你得说清楚你是用的什么载体,TA克隆还是酶切后连的,不然不好分析

我是PCR产物来的,麻烦了
5楼2012-02-06 11:41:37
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wzqno

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by wawjp at 2012-02-06 11:41:37:
我是PCR产物来的,麻烦了

PCR产物直接测序??还是PCR产物连到T载体上测序?
6楼2012-02-06 13:49:43
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wawjp

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by wzqno at 2012-02-06 13:49:43:
PCR产物直接测序??还是PCR产物连到T载体上测序?

PCR产物直接测序
7楼2012-02-06 13:56:57
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Charles-glh

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励应助! 2012-02-06 22:30:22
测序是分开测的,正反引物按照一个方向测序的,你的结果应该是对的!
8楼2012-02-06 17:31:37
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Rick001

铁杆木虫 (职业作家)

钓鱼岛环保首席秘书

有意思。关注一下,期待答案
☆☆☆想开了,便能走出去☆☆☆
9楼2012-02-06 18:42:43
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c3024034

银虫 (正式写手)

你的PCR反应引物设计有无问题啊?
10楼2012-02-06 18:51:50
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