24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 4103  |  回复: 12

中原揽辔

铜虫 (初入文坛)

[求助] 转化后做蓝白斑筛选,平板长出蓝白斑后挑取白班PCR鉴定阴性,是什么原因? 已有5人参与

转化后做蓝白斑筛选,平板涂布15小时后长出蓝白斑,挑取白班增菌培养后PCR鉴定全部显示阴性。PCR直接用菌液跑的,请问出现这种状况是因为转化没成功还是PCR有问题?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yuren2009

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 中原揽辔 at 2014-09-09 14:52:04
筛选数量也不少了,虽然每种菌只做了两管,但是我一共做了7种细菌。我用菌液跑的PCR,但是跑出来的电泳图有拖尾现象,条带最亮的位置在100-200之间,我怀疑是引物二聚体。请问你们跑PCR时菌液一般加多少,细菌蛋白 ...

用牙签蘸在PCR管里抖一下就可以了;摇菌16h左右,吸取1μL加进去PCR就可了。不用考虑细菌蛋白,毕竟样品很少。
学习使你立于不败之地
7楼2014-09-09 15:44:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-09-09 18:10:22
中原揽辔: 金币+1 2014-09-19 09:18:41
白斑中也有阴性的,建议扩大菌落的筛的的数量,活着挑菌后再摇,用菌液PCR验证。
学习使你立于不败之地
2楼2014-09-09 10:16:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qapollo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-09-09 18:10:31
中原揽辔: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-09-10 12:02:11
不太清楚你用的是什么载体,但是有些载体在酶切后是可以自连的,结果就和插入了目的片段一样表现为白斑。因此蓝白斑不是确定阳性的唯一、准确方法,还需要PCR、测序等等。应对这种情况应该多挑几个克隆,一般来说一个载体挑8~12个就可以了。
3楼2014-09-09 13:02:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

中原揽辔

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by qapollo at 2014-09-09 13:02:17
不太清楚你用的是什么载体,但是有些载体在酶切后是可以自连的,结果就和插入了目的片段一样表现为白斑。因此蓝白斑不是确定阳性的唯一、准确方法,还需要PCR、测序等等。应对这种情况应该多挑几个克隆,一般来说一 ...

用的是T载体,我做了好几种细菌每种细菌挑了2管,都没跑出来。请问载体自连的几率很大吗?
4楼2014-09-09 14:44:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

中原揽辔

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-09-09 10:16:16
白斑中也有阴性的,建议扩大菌落的筛的的数量,活着挑菌后再摇,用菌液PCR验证。

筛选数量也不少了,虽然每种菌只做了两管,但是我一共做了7种细菌。我用菌液跑的PCR,但是跑出来的电泳图有拖尾现象,条带最亮的位置在100-200之间,我怀疑是引物二聚体。请问你们跑PCR时菌液一般加多少,细菌蛋白质会不会干扰PCR?
5楼2014-09-09 14:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qapollo

金虫 (小有名气)

★ ★
中原揽辔(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-10 08:53:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by 中原揽辔 at 2014-09-09 14:44:47
用的是T载体,我做了好几种细菌每种细菌挑了2管,都没跑出来。请问载体自连的几率很大吗?...

几年前的时候我用TAKARA-18t载体做Ta克隆,片段在1K到2K,每次连4h,都能连接成功。今年的时候还是用18T载体,片段在1K左右,还是连4h,结果满板的白斑PCR却都是阴性,后来改成连接15min到30min就没问题了。如果你连接用的时间较长就容易自连,而且从我的试验来看4h的时候可能是100%自连。
6楼2014-09-09 15:21:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

中原揽辔

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-09-09 15:44:43
用牙签蘸在PCR管里抖一下就可以了;摇菌16h左右,吸取1μL加进去PCR就可了。不用考虑细菌蛋白,毕竟样品很少。...

如果菌液加多了会不会有影响?25μl的体系我加了10倍浓缩的10μl菌液。。。
8楼2014-09-09 16:30:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 中原揽辔 at 2014-09-09 16:30:55
如果菌液加多了会不会有影响?25μl的体系我加了10倍浓缩的10μl菌液。。。...

模板量太大了,反映物质浓度相对降低了,对体系肯定有影响。试着把预变性的温度提高和时间延长试试。
学习使你立于不败之地
9楼2014-09-09 19:08:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘芬玲

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
中原揽辔(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-10 08:54:05
在摇菌前先做个菌落PCR,用ddH2O做对照,然后再挑选阳性菌落摇菌试试,这样可以缩短实验时间
10楼2014-09-09 21:46:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 中原揽辔 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工学硕 285求调剂 +19 Wisjxn 2026-04-07 19/950 2026-04-07 17:49 by NN.
[考研] 求调剂 +7 月@163.com 2026-04-07 8/400 2026-04-07 17:24 by 蓝云思雨
[考研] 化工求调剂! +24 RichLi_ 2026-04-06 24/1200 2026-04-07 17:17 by 蓝云思雨
[考研] 化学308分求调剂 +10 你好明天你好 2026-04-07 12/600 2026-04-07 17:08 by rl1980
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +3 祁柒连 2026-04-06 3/150 2026-04-07 12:48 by 小木虫gyh
[考研] 求调剂 一志愿西南交通大学085701环境工程 282分 +13 多多爱吃汉堡 2026-04-04 14/700 2026-04-07 11:22 by 诗与自由
[论文投稿] Decision: Revise for Editor还会送审吗 100+3 CccccccccFD 2026-04-04 5/250 2026-04-07 10:58 by 北京莱茵润色
[考研] 华南理工0703化学,总分336求调剂 +10 手机用户 2026-04-03 11/550 2026-04-06 22:20 by michael2011
[考研] 化学357分,考研调剂 +11 .Starry. 2026-04-04 12/600 2026-04-06 06:28 by houyaoxu
[考研] 301求调剂 +3 XYPLR 2026-04-05 4/200 2026-04-05 19:07 by XYPLR
[考研] 一志愿北京化工大学,初试成绩350求调剂 +9 沿岸?贝壳 2026-04-04 14/700 2026-04-05 01:09 by 沿岸?贝壳
[考研] 342求调剂 +3 Liang7111 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:47 by dongzh2009
[考研] 295求调剂 +3 尚偌呀 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:23 by zhq0425
[考研] 一志愿华中农业071010,总分320求调剂 +7 困困困困坤坤 2026-04-02 7/350 2026-04-03 17:26 by Yuena_Wang
[考研] 283求调剂 +3 jiouuu 2026-04-03 4/200 2026-04-03 13:28 by jiouuu
[考研] 321求调剂 +17 y-yh 2026-04-01 20/1000 2026-04-03 12:57 by y-yh
[考研] 338求调剂,一志愿能源动力,外语是日语203 +5 zzz,,r 2026-04-02 5/250 2026-04-03 09:45 by 蓝云思雨
[考研] 318求调剂,计算材料方向 +10 吸喵有害笙命 2026-04-01 11/550 2026-04-02 16:29 by oooqiao
[考研] 生物学327,求调剂 +5 书上的梅子 2026-04-01 6/300 2026-04-02 06:47 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-03-31 11/550 2026-04-01 09:43 by xiayizhi
信息提示
请填处理意见