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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 转化后做蓝白斑筛选，平板长出蓝白斑后挑取白班PCR鉴定阴性，是什么原因？
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中原揽辔

铜虫 (初入文坛)

[求助] 转化后做蓝白斑筛选，平板长出蓝白斑后挑取白班PCR鉴定阴性，是什么原因？ 已有5人参与

转化后做蓝白斑筛选，平板涂布15小时后长出蓝白斑，挑取白班增菌培养后PCR鉴定全部显示阴性。PCR直接用菌液跑的，请问出现这种状况是因为转化没成功还是PCR有问题？
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1楼 2014-09-09 09:06:50
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qapollo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-09-09 18:10:31
中原揽辔: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-09-10 12:02:11
不太清楚你用的是什么载体，但是有些载体在酶切后是可以自连的，结果就和插入了目的片段一样表现为白斑。因此蓝白斑不是确定阳性的唯一、准确方法，还需要PCR、测序等等。应对这种情况应该多挑几个克隆，一般来说一个载体挑8~12个就可以了。
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3楼2014-09-09 13:02:17
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-09-09 18:10:22
中原揽辔: 金币+1 2014-09-19 09:18:41
白斑中也有阴性的，建议扩大菌落的筛的的数量，活着挑菌后再摇，用菌液PCR验证。
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学习使你立于不败之地
2楼2014-09-09 10:16:16
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中原揽辔

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by qapollo at 2014-09-09 13:02:17
不太清楚你用的是什么载体，但是有些载体在酶切后是可以自连的，结果就和插入了目的片段一样表现为白斑。因此蓝白斑不是确定阳性的唯一、准确方法，还需要PCR、测序等等。应对这种情况应该多挑几个克隆，一般来说一 ...

用的是T载体，我做了好几种细菌每种细菌挑了2管，都没跑出来。请问载体自连的几率很大吗？
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4楼2014-09-09 14:44:47
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中原揽辔

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-09-09 10:16:16
白斑中也有阴性的，建议扩大菌落的筛的的数量，活着挑菌后再摇，用菌液PCR验证。

筛选数量也不少了，虽然每种菌只做了两管，但是我一共做了7种细菌。我用菌液跑的PCR，但是跑出来的电泳图有拖尾现象，条带最亮的位置在100-200之间，我怀疑是引物二聚体。请问你们跑PCR时菌液一般加多少，细菌蛋白质会不会干扰PCR？
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5楼2014-09-09 14:52:04
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