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misszwh

银虫 (小有名气)

[求助] QPCR扩增曲线异常 已有7人参与

我有对引物,普通PCR并电泳检测,条带很亮,大小也是我需要的,到了QPCR上,溶解曲线正常,扩增曲线很奇怪,没有CT值,你们遇到过吗?什么原因啊?金币不多啊,悬赏有限啊谢谢
QPCR扩增曲线异常
amplication plot.jpg


QPCR扩增曲线异常-1
melt curve.jpg
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forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-02-20 08:25:54
1)浓度太高了;2)就没有进行PCR酶活性成了问题;3)说不清的因素。
3楼2014-02-19 22:31:06
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jiaolong11a

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
感觉你的PCR产物很小啊,溶解曲线不会是引物二聚体的吧
多情总被无情扰。。。愁
6楼2014-02-20 08:35:32
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wangweijian

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的荧光信号值好低,我做的一般都是100000以上的,应该是探针出了问题,换个探针试试,或者把荧光PCR产物跑下电泳看看有没有产物,有产物的话肯定是探针的问题。
8楼2014-02-21 22:08:19
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普通回帖

shiyiyaya

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-02-20 08:25:48
没遇到类似情况。
DNA电泳能看见条带,说明有产物。
溶解曲线还可以,但不是很尖锐,说明反应孔没有选错误。

会不会有污染?或者探针失效?
有没有正对照或负对照?结果都类似吗?
2楼2014-02-19 22:21:38
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misszwh

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shiyiyaya at 2014-02-19 22:21:38
没遇到类似情况。
DNA电泳能看见条带,说明有产物。
溶解曲线还可以,但不是很尖锐,说明反应孔没有选错误。

会不会有污染?或者探针失效?
有没有正对照或负对照?结果都类似吗?

不会是污染的问题,我这对引物试了多次都是这个结果,内参引物的扩增是正常的。谢谢你的答复
4楼2014-02-20 00:53:02
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misszwh

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by forrestgump at 2014-02-19 22:31:06
1)浓度太高了;2)就没有进行PCR酶活性成了问题;3)说不清的因素。

我试了降低引物和模板的量,但是结果都一样。酶没有问题的。谢谢您的答复
5楼2014-02-20 00:54:15
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misszwh

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jiaolong11a at 2014-02-20 08:35:32
感觉你的PCR产物很小啊,溶解曲线不会是引物二聚体的吧

感觉是不大,但是二聚体的是不是没有这么大啊?
7楼2014-02-21 10:00:11
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你看一下你的定量反应的循环温度延长时间有没有问题?我们实验室之前有个同学做定量选择fast reaction导致定量上没有扩增。
hehe
9楼2014-02-22 20:04:52
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

...
    Melt curve中的值太低,绝度不是需要的扩增产物,引物二聚体的可能很大。你如果觉得有疑问,大可拿此产物跑2~3%的琼脂糖胶看一下,看看分子量大小。
    如有说错,请高手指正
Let God do with it as He wills
10楼2014-02-23 02:10:20
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