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Atlantistree

铁虫 (初入文坛)

[求助] 毕赤酵母表达时的杂蛋白问题 已有2人参与

我最近构建毕赤酵母X-33工程菌表达干扰素(20KD左右),摇瓶用BMMY表达时,蛋白很纯,没有40KD以上的蛋白,但是上罐后用基础盐离子培养基发酵后杂蛋白很多;之前还做过甘露聚糖酶(47KD左右)的表达,用基础盐离子上罐发酵时,表达蛋白很纯,没有杂蛋白。甘露聚糖酶和干扰素所用的穿梭质粒和毕赤酵母菌种完全相同,发酵工艺也相同。搞不清楚表达干扰素时,为何摇瓶表达没有杂蛋白,但是上罐后杂蛋白很多,而上罐表达甘露聚糖酶时,相同的发酵工艺,却没有杂蛋白,这种现象是由于菌体死亡造成的,还是和表达的蛋白有关?如果由于菌体自溶造成的,如何调整发酵工艺啊?求大神指点!
附上蛋白电泳图,一张是干扰素的发酵罐表达,一张是甘露聚糖酶的发酵罐表达。
毕赤酵母表达时的杂蛋白问题
干扰素发酵罐表达.jpg


毕赤酵母表达时的杂蛋白问题-1
甘露聚糖酶发酵罐表达.jpg
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上善若水
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

看你的描述和电泳图,都是胞外表达,直接发酵液上清上样是吧?组成型还是诱导型表达?用的BMMY和盐培养基,应该是诱导型,需要看你的质粒图谱(标明各元件即可)还有发酵大体步骤。

初步推断:毕赤酵母表达外源蛋白时,会有不同程度的糖基化现象,上罐进行高密度发酵的糖基化现象肯定比摇瓶要明显很多。另外,你的产物电泳显示有杂蛋白,建议进行2个实验,western blot和酶活测试。

还有毕赤酵母的上罐可能不能较频繁,所以建议多做几罐比较下结果。

上述5个问题的情况能够详细描述的话,问题应该能够确定。
4楼2014-01-26 12:14:39
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

还有建议,如果真的是讨论问题还是要尽可能的把问题说清楚,最基本的把电泳图说清楚吧。不要忽略细节。我们做实验,任何一张正常有意义有结果的电泳图都要以发表文章的要求进行标识、说明和处理。
5楼2014-01-26 12:17:40
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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Atlantistree: 金币+10, 有帮助 2014-02-11 11:31:32
引用回帖:
6楼: Originally posted by Atlantistree at 2014-02-02 16:04:39
是直接上的发酵上清跑的电泳;质粒用的是PICZαA;发酵过程大概是上罐后36~42小时左右甘油补料长生物量,之后是甲醇诱导,甲醇补料速度先慢后快,根据溶氧控制补料速度,溶氧控制在30%左右。干扰素序列中有一个潜在 ...

那主要是杂蛋白的问题,甲醇诱导添加时要把我准时间,其次甲醇诱导期间个人认为溶氧太高了,菌体碳源不够,有凋亡比较正常。开始诱导后的发酵液OD变化如何?能达到多少?

抱歉之前过年回家,一直没上小木虫,所以没能及时交流。
7楼2014-02-10 23:21:46
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Atlantistree: 金币+15, 有帮助 2014-02-13 09:09:40
引用回帖:
8楼: Originally posted by Atlantistree at 2014-02-11 11:31:40
蛋白在菌体内折叠修饰是耗氧过程,溶氧不足会影响蛋白活性,这个我在做甘露聚糖酶发酵时溶氧是否充足活性变化很明显,而且看很多文献基本上都把溶氧控制在20%-50%。在补料过程中通富氧空气,蠕动泵一工作补甲醇,溶 ...

我做了几种都不会有杂蛋白的。诱导阶段OD值(生物量)升高是最好的。我一般在OD达到280才会诱导。诱导期间甲醇补料速度控制溶氧至-5%到5%之间。
仅供参考。
9楼2014-02-13 00:04:39
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reallpf

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by Atlantistree at 2014-02-13 09:03:30
多谢帮忙,我再多做几批试一下。
另外在上罐时,你使用的是Invitrogen提供的BSM培养基么?我看有文献用的培养基盐离子浓度比BSM低好多,在甘油/甲醇补料阶段也要分别补加培养基,不知你做过类似的工艺实验没?...

一般是BSM,但都会做一些改良的,调整各个成分。我做工业表达,所以原料也都是非常粗糙的。后续补料过程中,一般不再添加其它培养基了。
11楼2014-02-13 22:09:12
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