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Atlantistree

铁虫 (初入文坛)

[求助] 毕赤酵母表达时的杂蛋白问题 已有2人参与

我最近构建毕赤酵母X-33工程菌表达干扰素(20KD左右),摇瓶用BMMY表达时,蛋白很纯,没有40KD以上的蛋白,但是上罐后用基础盐离子培养基发酵后杂蛋白很多;之前还做过甘露聚糖酶(47KD左右)的表达,用基础盐离子上罐发酵时,表达蛋白很纯,没有杂蛋白。甘露聚糖酶和干扰素所用的穿梭质粒和毕赤酵母菌种完全相同,发酵工艺也相同。搞不清楚表达干扰素时,为何摇瓶表达没有杂蛋白,但是上罐后杂蛋白很多,而上罐表达甘露聚糖酶时,相同的发酵工艺,却没有杂蛋白,这种现象是由于菌体死亡造成的,还是和表达的蛋白有关?如果由于菌体自溶造成的,如何调整发酵工艺啊?求大神指点!
附上蛋白电泳图,一张是干扰素的发酵罐表达,一张是甘露聚糖酶的发酵罐表达。
毕赤酵母表达时的杂蛋白问题
干扰素发酵罐表达.jpg


毕赤酵母表达时的杂蛋白问题-1
甘露聚糖酶发酵罐表达.jpg
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上善若水
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Atlantistree

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by reallpf at 2014-01-26 12:14:39
看你的描述和电泳图,都是胞外表达,直接发酵液上清上样是吧?组成型还是诱导型表达?用的BMMY和盐培养基,应该是诱导型,需要看你的质粒图谱(标明各元件即可)还有发酵大体步骤。

初步推断:毕赤酵母表达外源蛋 ...

是直接上的发酵上清跑的电泳;质粒用的是PICZαA;发酵过程大概是上罐后36~42小时左右甘油补料长生物量,之后是甲醇诱导,甲醇补料速度先慢后快,根据溶氧控制补料速度,溶氧控制在30%左右。干扰素序列中有一个潜在糖基化位点,但糖基化对蛋白分子量的影响应该不会特别大吧。上面干扰素电泳图中,40KD以上的都是杂蛋白,不同的泳道是不同发酵时间取的样品。干扰素这个菌种我也上过很多次罐了,都有杂蛋白,估计这杂蛋白很有可能是菌体死亡后产生的,但是发酵工艺与甘露聚糖酶的大致相同,不知为何会出现这种状况。你说的酶活性和干扰素活性都能检测出来,但是干扰素有杂蛋白,使后面的纯化还要过离子交换柱什么的,就比较麻烦。
上善若水
6楼2014-02-02 16:04:39
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lcat

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Atlantistree: 金币+5, 有帮助, 感谢帮助 2014-01-23 10:36:18
是干扰素蛋白产量低吗?干扰素和甘露聚糖酶这两张电泳图,发酵液上样体积是一样的吗?
2楼2014-01-22 21:21:09
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Atlantistree

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lcat at 2014-01-22 21:21:09
是干扰素蛋白产量低吗?干扰素和甘露聚糖酶这两张电泳图,发酵液上样体积是一样的吗?

嗯,干扰素产量是比较低。上样量不一样,甘露聚糖酶的上样量大概有5微吧,这是好早之前做的图。近期做过一次甘露聚糖酶的发酵上样量20微,与干扰素的上样量相同,但还是没有杂蛋白,我就很纠结……
上善若水
3楼2014-01-23 08:29:01
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

看你的描述和电泳图,都是胞外表达,直接发酵液上清上样是吧?组成型还是诱导型表达?用的BMMY和盐培养基,应该是诱导型,需要看你的质粒图谱(标明各元件即可)还有发酵大体步骤。

初步推断:毕赤酵母表达外源蛋白时,会有不同程度的糖基化现象,上罐进行高密度发酵的糖基化现象肯定比摇瓶要明显很多。另外,你的产物电泳显示有杂蛋白,建议进行2个实验,western blot和酶活测试。

还有毕赤酵母的上罐可能不能较频繁,所以建议多做几罐比较下结果。

上述5个问题的情况能够详细描述的话,问题应该能够确定。
4楼2014-01-26 12:14:39
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