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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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windleakey

金虫 (小有名气)

[求助] SDS PAGE 小肽?

大家好:
由于以前对小肽不了解,所以跑电泳遇到了问题,下面是我的电泳图,Marker最小的带是14kd,我的蛋白是5kd多,我的问题是,小肽超过了分离胶的分辨范围,是完全不会显示条带吗?换一种说法就是,单凭我的图是否能确定我的蛋白有没有诱导出来吗?我转化用的是毕赤酵母,所以没什么分泌杂蛋白。 希望有大神能帮我。。。另外有关于小肽电泳的资料(Tricine sds page之类的),希望发我一份,谢谢了
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sl35537417

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
同意楼上说法,你可以用45%的丙烯酰胺,然后跑tricine胶 专门跑10KD以下的蛋白  效果较好
参考http://www.nature.com/nprot/journal/v1/n1/full/nprot.2006.4.html
8楼2012-08-24 09:09:51
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普通回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
好像是分子量小的跑的快,那你的胶最上面的那条14KD,5KD的早出去了。能不能缩短电泳时间?
2楼2012-08-22 08:14:27
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悠悠落叶

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-08-22 18:12:46
5K多的分子量,我还是建议使用液相色谱,然后确定差不多了在进行液相的制备,分离出来你想要的组分,然后做MALDI-TOF看看是不是你想要的序列,分子量对的上再做个氨基酸序列分析就好了,你的肽分子量太小了,能问一下表达的是什么啊?是用的质粒表达吗?
索马鲁肽,利拉鲁肽,德谷胰岛素,InsulinIcodec胰岛素侧链,发酵索玛/利拉直链热卖
3楼2012-08-22 09:51:36
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wtery

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励积极发帖帮助解答问题。 2012-08-22 18:12:52
5K的蛋白太小了,一般15%的胶也只能分到10k,你的蛋白可能比溴酚蓝跑的还快,早就出去了,
你可以试试,跑到一半就停,可能在下面能找到你的蛋白,
4楼2012-08-22 17:42:23
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by 悠悠落叶 at 2012-08-22 09:51:36
5K多的分子量,我还是建议使用液相色谱,然后确定差不多了在进行液相的制备,分离出来你想要的组分,然后做MALDI-TOF看看是不是你想要的序列,分子量对的上再做个氨基酸序列分析就好了,你的肽分子量太小了,能问一 ...

5K做LC-MS是不是有点偏大?
5楼2012-08-23 05:58:57
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yyk81

木虫 (正式写手)

用你现在的方法肯定跑不出来,你需要改变丙烯酰胺和双丙烯酰胺的比值,捉高交连度,还要用三层胶。跟距我的提示,你自己查一下,要享受查找的过程。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
学无止境!
6楼2012-08-24 08:03:54
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yyk81

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用你现在的方法肯定跑不出来,你需要改变丙烯酰胺和双丙烯酰胺的比值,捉高交连度,还要用三层胶。跟距我的提示,你自己查一下,要享受查找的过程。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
学无止境!
7楼2012-08-24 08:04:20
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悠悠落叶

金虫 (正式写手)

★ ★
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖! 2012-09-04 17:41:14
引用回帖:
5楼: Originally posted by wizardfan at 2012-08-23 05:58:57
5K做LC-MS是不是有点偏大?...

不是做LC-MS,我那天说的意思是:是先做HPLC分析一下,看看里面的情况,可不可以纯化一下再做MALDI-TOF,另外MALDI-TOF是不可以和LC连用的,ESI什么的是可以喝LC连用,所以叫LC-MS,而MALDI-TOF是要和基质一起结晶到靶上,然后用激光辅助电离的,而且5KD的分子量走HPLC没什么问题
或者说是LC-MS也行,基本上就是给你做成多电荷峰,也就是说是1/3峰,1/4峰,这样的话你在算回去就行了
索马鲁肽,利拉鲁肽,德谷胰岛素,InsulinIcodec胰岛素侧链,发酵索玛/利拉直链热卖
9楼2012-08-24 13:39:24
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

引用回帖:
9楼: Originally posted by 悠悠落叶 at 2012-08-24 13:39:24
不是做LC-MS,我那天说的意思是:是先做HPLC分析一下,看看里面的情况,可不可以纯化一下再做MALDI-TOF,另外MALDI-TOF是不可以和LC连用的,ESI什么的是可以喝LC连用,所以叫LC-MS,而MALDI-TOF是要和基质一起结晶 ...

LC-MS是液相质谱,液相起到分离的作用,MS起到检测的作用。
在MS里,ESI,MALDI是ionizer,就是两种不同的方法,TOF和TRAP是不同的detector,这样理论上说就有4种MS,都可以和LC联用。而不是像你所说的那样。
10楼2012-08-24 16:53:29
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