24小时热门版块排行榜    

查看: 3296  |  回复: 19
本帖产生 1 个 BioEPI ,点击这里进行查看

liyouran85

金虫 (小有名气)

[求助] 毕赤酵母表达问题求教

使用载体pPIC9K整合表达,基因来源于细菌,根据序列预测的分子量为100 kDa左右,可是表达出来的蛋白大小在70 kDa左右,且不具备酶活,请问有可能哪些地方出现了问题?谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

酵母表达纯化一站式解决! 蛋白表达纯化鉴定精华

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

post_ngao

木虫 (正式写手)

科研宅

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
silicare: 金币+50, BioEPI+1, 楼主奖励 2012-05-03 15:43:32
第一,细菌来源的蛋白为什么要用酵母表达?原核蛋白用E coli就可以了啊。
第二,就算你要用毕赤酵母表达,那么你的原核来源基因是否经过优化?因为毕赤酵母中是存在非通用密码子的。
第三,分子量变小,第一时间必须果断测序,仔细检查是否存在移码突变、点突变等的问题,还必须考虑非通用密码子的问题。
第四,没有酶活力,除了序列的问题,我个人感觉还有使用毕赤酵母的原因。因为用酵母最多的就是在利用它的糖基化能力,而毕赤酵母的过糖基化是出了名的,并且N、O糖基化位点很难预测。你的蛋白是原核来源的,它在行使催化功能的时候是不需要糖基化的,如果给它强加入糖基化非常有可能堵住底物通道或者使得cap有位阻打不开,就属于多此一举了。
第五,同一个蛋白序列,用E coli和酵母分别表达时,其最终的折叠状态也是不同的,这也可能是没有活力的原因之一。

所知信息不多,只能大致说说,具体情况还得具体分析。有需要可以联系我。
天命所归,各安其位
3楼2012-05-03 10:16:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

post_ngao

木虫 (正式写手)

科研宅

原始的毕赤酵母确实存在着蛋白酶,不过现在一般的工程菌都是蛋白酶敲除型的,你可以在网上查一下你的毕赤酵母的型号,比如GS-115等,就可以知道是否为蛋白酶敲除型的了。

另外我看你用的质粒是pPICZ9K,9K可以跨膜吗?貌似上面没有α-factor 的信号肽吧?没有的话就不会跨膜。如果你一定怀疑是蛋白酶的话,可以在培养基中加入蛋白酶抑制剂,比如最常用的PMSF. 我也曾经尝试过,对表达量影响不大,可以试一下。

PMSF:1)10mg/ml溶于异丙醇中; 在室温下可保存一年;
      2)工作浓度:17~174ug/ml(0.1~1.0mmol/L);
      3)在水液体溶液中不稳定,必须在每一次分离和纯化步骤中加入新鲜的PMSF。
天命所归,各安其位
8楼2012-05-03 20:38:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

nemo88

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liyouran85: 金币+50, 有帮助, 5 2012-05-03 15:37:43
silicare: 金币-45, 楼主操作失误,补偿5个金币 2012-05-03 15:44:45
本帖内容被屏蔽

2楼2012-05-02 23:17:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyouran85

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by post_ngao at 2012-05-03 10:16:36:
第一,细菌来源的蛋白为什么要用酵母表达?原核蛋白用E coli就可以了啊。
第二,就算你要用毕赤酵母表达,那么你的原核来源基因是否经过优化?因为毕赤酵母中是存在非通用密码子的。
第三,分子量变小,第一时间 ...

谢谢您的详细分析,构建的重组质粒连入的基因部分已经过测序,证明无误;由于分子量变小,个人猜测是不是有可能是跨膜时肽酶的切割所致,因为看到过毕赤酵母中肽酶的相关报道,请问您了解这方面吗?如果是这样的问题,该如何处理?谢谢!
4楼2012-05-03 16:05:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyouran85

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by post_ngao at 2012-05-03 10:16:36:
第一,细菌来源的蛋白为什么要用酵母表达?原核蛋白用E coli就可以了啊。
第二,就算你要用毕赤酵母表达,那么你的原核来源基因是否经过优化?因为毕赤酵母中是存在非通用密码子的。
第三,分子量变小,第一时间 ...

我觉得首先要解决的问题就是为何表达出了分子量变小的蛋白。
5楼2012-05-03 16:06:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

danbomingyue

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2012-05-03 16:53:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

danbomingyue

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

7楼2012-05-03 16:57:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feilinshiji

银虫 (小有名气)

原核蛋白为什么要用酵母表达???原核蛋白在真核表达系统中有活性吗???目的基因有没有突变导致提前终止?
9楼2012-05-04 00:25:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wurenzhi0721

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by post_ngao at 2012-05-03 20:38:58
原始的毕赤酵母确实存在着蛋白酶,不过现在一般的工程菌都是蛋白酶敲除型的,你可以在网上查一下你的毕赤酵母的型号,比如GS-115等,就可以知道是否为蛋白酶敲除型的了。

另外我看你用的质粒是pPICZ9K,9K可以跨 ...

好厉害啊
你快乐所以我快乐,我快乐所以大家也快乐
10楼2012-08-14 22:50:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liyouran85 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +9 不知道叫什么! 2026-03-15 10/500 2026-03-16 10:04 by houyaoxu
[考研] 东南大学364求调剂 +4 JasonYuiui 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:36 by Linda Hu
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +12 enenenhui 2026-03-13 13/650 2026-03-16 08:30 by Linda Hu
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +4 Liwangman 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:01 by wang_dand
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 清风问长安 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:15 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 285求调剂 +4 ytter 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:48 by jxchenghu
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 274求调剂0856材料化工 +12 z2839474511 2026-03-11 13/650 2026-03-13 10:39 by peike
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
[考研] 求调剂材料专硕293 +6 段_(:з」∠)_ 2026-03-10 6/300 2026-03-10 18:22 by ms629
信息提示
请填处理意见