24小时热门版块排行榜    

查看: 3295  |  回复: 19
本帖产生 1 个 BioEPI ,点击这里进行查看

liyouran85

金虫 (小有名气)

[求助] 毕赤酵母表达问题求教

使用载体pPIC9K整合表达,基因来源于细菌,根据序列预测的分子量为100 kDa左右,可是表达出来的蛋白大小在70 kDa左右,且不具备酶活,请问有可能哪些地方出现了问题?谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

酵母表达纯化一站式解决! 蛋白表达纯化鉴定精华

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

post_ngao

木虫 (正式写手)

科研宅

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
silicare: 金币+50, BioEPI+1, 楼主奖励 2012-05-03 15:43:32
第一,细菌来源的蛋白为什么要用酵母表达?原核蛋白用E coli就可以了啊。
第二,就算你要用毕赤酵母表达,那么你的原核来源基因是否经过优化?因为毕赤酵母中是存在非通用密码子的。
第三,分子量变小,第一时间必须果断测序,仔细检查是否存在移码突变、点突变等的问题,还必须考虑非通用密码子的问题。
第四,没有酶活力,除了序列的问题,我个人感觉还有使用毕赤酵母的原因。因为用酵母最多的就是在利用它的糖基化能力,而毕赤酵母的过糖基化是出了名的,并且N、O糖基化位点很难预测。你的蛋白是原核来源的,它在行使催化功能的时候是不需要糖基化的,如果给它强加入糖基化非常有可能堵住底物通道或者使得cap有位阻打不开,就属于多此一举了。
第五,同一个蛋白序列,用E coli和酵母分别表达时,其最终的折叠状态也是不同的,这也可能是没有活力的原因之一。

所知信息不多,只能大致说说,具体情况还得具体分析。有需要可以联系我。
天命所归,各安其位
3楼2012-05-03 10:16:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

post_ngao

木虫 (正式写手)

科研宅

原始的毕赤酵母确实存在着蛋白酶,不过现在一般的工程菌都是蛋白酶敲除型的,你可以在网上查一下你的毕赤酵母的型号,比如GS-115等,就可以知道是否为蛋白酶敲除型的了。

另外我看你用的质粒是pPICZ9K,9K可以跨膜吗?貌似上面没有α-factor 的信号肽吧?没有的话就不会跨膜。如果你一定怀疑是蛋白酶的话,可以在培养基中加入蛋白酶抑制剂,比如最常用的PMSF. 我也曾经尝试过,对表达量影响不大,可以试一下。

PMSF:1)10mg/ml溶于异丙醇中; 在室温下可保存一年;
      2)工作浓度:17~174ug/ml(0.1~1.0mmol/L);
      3)在水液体溶液中不稳定,必须在每一次分离和纯化步骤中加入新鲜的PMSF。
天命所归,各安其位
8楼2012-05-03 20:38:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

nemo88

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liyouran85: 金币+50, 有帮助, 5 2012-05-03 15:37:43
silicare: 金币-45, 楼主操作失误,补偿5个金币 2012-05-03 15:44:45
本帖内容被屏蔽

2楼2012-05-02 23:17:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyouran85

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by post_ngao at 2012-05-03 10:16:36:
第一,细菌来源的蛋白为什么要用酵母表达?原核蛋白用E coli就可以了啊。
第二,就算你要用毕赤酵母表达,那么你的原核来源基因是否经过优化?因为毕赤酵母中是存在非通用密码子的。
第三,分子量变小,第一时间 ...

谢谢您的详细分析,构建的重组质粒连入的基因部分已经过测序,证明无误;由于分子量变小,个人猜测是不是有可能是跨膜时肽酶的切割所致,因为看到过毕赤酵母中肽酶的相关报道,请问您了解这方面吗?如果是这样的问题,该如何处理?谢谢!
4楼2012-05-03 16:05:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyouran85

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by post_ngao at 2012-05-03 10:16:36:
第一,细菌来源的蛋白为什么要用酵母表达?原核蛋白用E coli就可以了啊。
第二,就算你要用毕赤酵母表达,那么你的原核来源基因是否经过优化?因为毕赤酵母中是存在非通用密码子的。
第三,分子量变小,第一时间 ...

我觉得首先要解决的问题就是为何表达出了分子量变小的蛋白。
5楼2012-05-03 16:06:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

danbomingyue

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2012-05-03 16:53:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

danbomingyue

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

7楼2012-05-03 16:57:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feilinshiji

银虫 (小有名气)

原核蛋白为什么要用酵母表达???原核蛋白在真核表达系统中有活性吗???目的基因有没有突变导致提前终止?
9楼2012-05-04 00:25:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wurenzhi0721

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by post_ngao at 2012-05-03 20:38:58
原始的毕赤酵母确实存在着蛋白酶,不过现在一般的工程菌都是蛋白酶敲除型的,你可以在网上查一下你的毕赤酵母的型号,比如GS-115等,就可以知道是否为蛋白酶敲除型的了。

另外我看你用的质粒是pPICZ9K,9K可以跨 ...

好厉害啊
你快乐所以我快乐,我快乐所以大家也快乐
10楼2012-08-14 22:50:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liyouran85 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学工程321分求调剂 +6 大米饭! 2026-03-15 6/300 2026-03-16 07:58 by wang_dand
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +6 Ncdx123456 2026-03-13 7/350 2026-03-16 07:44 by L135790
[考研] 化学调剂0703 +7 啊我我的 2026-03-11 7/350 2026-03-15 23:03 by 凌千颂111
[基金申请] 国自科面上基金字体 +4 iwuli 2026-03-12 5/250 2026-03-15 17:07 by 风云无泪
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 085600材料与化工 326 求调剂 +5 热爱生活ing 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:39 by JourneyLucky
[考研] 一志愿北京化工大学材料与化工296分求调剂 +16 稻妻小编 2026-03-09 18/900 2026-03-14 02:00 by JourneyLucky
[考研] 一志愿天津大学,英一数二305分求调剂,四六级已过 +8 小小番的茄 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:53 by JourneyLucky
[考研] 求调剂! +4 朔朔话 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:38 by JourneyLucky
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +9 Copy267 2026-03-10 9/450 2026-03-13 23:45 by userper
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +7 mysdl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 22:43 by JourneyLucky
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考研] 283求调剂,材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
[考研] 085600 材料与化工 295 求调剂 +10 dream…… 2026-03-10 12/600 2026-03-12 13:46 by dream……
[考研] 0857环境调剂 +5 熠熠_11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 10:59 by wang_dand
[考研] 求调剂材料专硕293 +6 段_(:з」∠)_ 2026-03-10 6/300 2026-03-10 18:22 by ms629
信息提示
请填处理意见