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melodyxin

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】用毕赤酵母表达载体pPIC9K表达蛋白时分子量的估计? 已有4人参与

请问各位,我用毕赤酵母表达载体表达目的蛋白,在估计蛋白分子量时,是否要在目的蛋白编码氨基酸前加上信号肽的部分序列,还是说只要单纯估计目的蛋白的大小就可以了?

现在的情况,单纯目的蛋白分子量是51.5kDa,但我蛋白电泳跑出来的条带好像是在54kDa左右的样子。
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
西瓜(金币+2): 回答很详细 2011-04-09 20:57:52
西瓜(金币+3, EPI+1): 专业呢,呵呵 2011-04-11 22:48:46
按道理是蛋白分子量时除去信号肽部分,因为信号肽在穿过膜时会被信号肽酶切割掉的,剩下的只是成熟肽。但是工程菌经常会出现切割不完全和表达的蛋白滞留胞内的情况,这时候蛋白的分子量是包括信号肽部分的。如果你的样品是来自发酵液,也就是分泌出来了的,就应该不包括信号肽部分。还有就是SDS-PAGE出来的分子量不一定准确的,有偏差,跟蛋白的组成和结构有关系。
2楼2011-04-09 20:37:44
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melodyxin

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lxj341401 at 2011-04-09 20:37:44:
按道理是蛋白分子量时除去信号肽部分,因为信号肽在穿过膜时会被信号肽酶切割掉的,剩下的只是成熟肽。但是工程菌经常会出现切割不完全和表达的蛋白滞留胞内的情况,这时候蛋白的分子量是包括信号肽部分的。如果你 ...

好的!非常感谢!!
3楼2011-04-11 21:25:41
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兔兔yy070330

铜虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
wanhscn(金币+1): 鼓励交流 2011-09-05 22:10:46
引用回帖:
1楼: Originally posted by melodyxin at 2011-04-09 18:46:00:
请问各位,我用毕赤酵母表达载体表达目的蛋白,在估计蛋白分子量时,是否要在目的蛋白编码氨基酸前加上信号肽的部分序列,还是说只要单纯估计目的蛋白的大小就可以了?

现在的情况,单纯目的蛋白分子量是51.5k ...

在毕赤酵母中表达的蛋白会受到糖基化的作用,是会比目的蛋白的分子量稍大点的
4楼2011-09-05 21:52:00
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zhuzhuwinner

禁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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5楼2021-07-16 16:41:21
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