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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Atlantistree

铁虫 (初入文坛)

[求助] 毕赤酵母表达时的杂蛋白问题 已有2人参与

我最近构建毕赤酵母X-33工程菌表达干扰素(20KD左右),摇瓶用BMMY表达时,蛋白很纯,没有40KD以上的蛋白,但是上罐后用基础盐离子培养基发酵后杂蛋白很多;之前还做过甘露聚糖酶(47KD左右)的表达,用基础盐离子上罐发酵时,表达蛋白很纯,没有杂蛋白。甘露聚糖酶和干扰素所用的穿梭质粒和毕赤酵母菌种完全相同,发酵工艺也相同。搞不清楚表达干扰素时,为何摇瓶表达没有杂蛋白,但是上罐后杂蛋白很多,而上罐表达甘露聚糖酶时,相同的发酵工艺,却没有杂蛋白,这种现象是由于菌体死亡造成的,还是和表达的蛋白有关?如果由于菌体自溶造成的,如何调整发酵工艺啊?求大神指点!
附上蛋白电泳图,一张是干扰素的发酵罐表达,一张是甘露聚糖酶的发酵罐表达。
毕赤酵母表达时的杂蛋白问题
干扰素发酵罐表达.jpg


毕赤酵母表达时的杂蛋白问题-1
甘露聚糖酶发酵罐表达.jpg
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上善若水
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Atlantistree

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by reallpf at 2014-02-10 23:21:46
那主要是杂蛋白的问题,甲醇诱导添加时要把我准时间,其次甲醇诱导期间个人认为溶氧太高了,菌体碳源不够,有凋亡比较正常。开始诱导后的发酵液OD变化如何?能达到多少?

抱歉之前过年回家,一直没上小木虫,所 ...

蛋白在菌体内折叠修饰是耗氧过程,溶氧不足会影响蛋白活性,这个我在做甘露聚糖酶发酵时溶氧是否充足活性变化很明显,而且看很多文献基本上都把溶氧控制在20%-50%。在补料过程中通富氧空气,蠕动泵一工作补甲醇,溶氧就开始下降,当溶氧升到50%左右时开始下一次补料,这个过程时间不是很长,会因为碳源不够造成菌体死亡么?
开始诱导后发酵液的OD值我倒是没测过,我是用湿菌重来衡量,湿菌重达到200 mg/mL左右时开始诱导,诱导期生物量也在增长,但比较缓慢,最后能达到湿菌重350 mg/mL左右。是不是在诱导阶段控制生物量维持恒定会比较好?估计杂蛋白是菌体死亡裂解出来的,很多文献里酵母表达的蛋白电泳图中都含有40KD以上的杂蛋白,这或许是种普遍现象?像我做的甘露聚糖酶这种杂蛋白很少的情况可能比较特殊,就是搞不明白是怎么造成的……


太客气了,还没感谢你参与讨论呢……
上善若水
8楼2014-02-11 11:31:40
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lcat

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Atlantistree: 金币+5, 有帮助, 感谢帮助 2014-01-23 10:36:18
是干扰素蛋白产量低吗?干扰素和甘露聚糖酶这两张电泳图,发酵液上样体积是一样的吗?
2楼2014-01-22 21:21:09
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Atlantistree

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lcat at 2014-01-22 21:21:09
是干扰素蛋白产量低吗?干扰素和甘露聚糖酶这两张电泳图,发酵液上样体积是一样的吗?

嗯,干扰素产量是比较低。上样量不一样,甘露聚糖酶的上样量大概有5微吧,这是好早之前做的图。近期做过一次甘露聚糖酶的发酵上样量20微,与干扰素的上样量相同,但还是没有杂蛋白,我就很纠结……
上善若水
3楼2014-01-23 08:29:01
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

看你的描述和电泳图,都是胞外表达,直接发酵液上清上样是吧?组成型还是诱导型表达?用的BMMY和盐培养基,应该是诱导型,需要看你的质粒图谱(标明各元件即可)还有发酵大体步骤。

初步推断:毕赤酵母表达外源蛋白时,会有不同程度的糖基化现象,上罐进行高密度发酵的糖基化现象肯定比摇瓶要明显很多。另外,你的产物电泳显示有杂蛋白,建议进行2个实验,western blot和酶活测试。

还有毕赤酵母的上罐可能不能较频繁,所以建议多做几罐比较下结果。

上述5个问题的情况能够详细描述的话,问题应该能够确定。
4楼2014-01-26 12:14:39
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