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lillian菲

银虫 (小有名气)

[求助] PCR大片段问题 已有2人参与

大家好,最近在p片段基因,大概有7500bp,因为需要做后续好多试验,需要PCR产物较多。之前PCR结果很好,最近p的结果总不理想。需要的条带在8000bp左右,但结果在6000bp的条带很亮,根本没法做胶回收,求大家帮忙解决,很急!
PCR大片段问题
360截图20130909163226089.jpg
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liujianmin68

木虫 (职业作家)

努力发展交叉学科

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-30 22:15:40
gyesang: 回帖置顶 2013-09-30 22:15:41
根据你的情况,建议你用touch down PCR进行扩增,先用较高的退火温度扩增几个循环,然后在选择合适的退火温度。
如果上面的方法不凑效,你可以选择更好质量的酶进行扩增。比如: TOYOBO公司的KOD FX、TaKaRa公司的Tks Gflex DNA聚合酶,前面一种我用过,即使模板量很少,也能扩增出很亮的条带,而且非常适合长片段的扩增。后面的一种是我在宝生物网站上看到的,目前自己还没有使用过。
希望我说的这些对你有所帮助。
转向地质微生物学
10楼2013-09-11 08:05:24
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普通回帖

因为吃饭

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-09-09 20:15:50
产物的特异性不好,提高退火温度呢?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

辩证。
2楼2013-09-09 16:41:44
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南海所老龚

新虫 (正式写手)

楼主用什么酶,扩这么大的片段?
TheBestandMostBeautifulThingsintheWorldCan'tBeSeenorTouched,TheyMustBeFeltwithHeart.
3楼2013-09-09 21:41:22
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先考虑使用专一性高的DNA聚合酶。
4楼2013-09-10 08:39:12
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lillian菲

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 因为吃饭 at 2013-09-09 16:41:44
产物的特异性不好,提高退火温度呢?

试过提高退火温度,还是有很多非特异性条带
5楼2013-09-10 10:00:42
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lillian菲

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 南海所老龚 at 2013-09-09 21:41:22
楼主用什么酶,扩这么大的片段?

高保真酶啊
6楼2013-09-10 10:01:02
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lillian菲

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-09-10 08:39:12
首先考虑使用专一性高的DNA聚合酶。

用的就是高保真的,以前有过好的结果,后来就不行了,很郁闷呢
7楼2013-09-10 10:01:32
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yinl03

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-10 22:04:39
引物设计的长一点,适当提高退火温度,或者实在不行,分成2-3段P,然后用overlap拼接起来,这样也是个选择,总比停滞不前好啊!
8楼2013-09-10 19:39:22
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hexia313

金虫 (小有名气)

分段P会好点

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2013-09-10 20:38:38
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