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xy19860508

铜虫 (小有名气)

[求助] 反转录之后PCR扩增片段问题的请教,急急急

小弟,最近在对流感病毒的HA基因片段进行扩增(先提RNA进行反转录,完成之后再进行的扩增),在扩增之前为保证RNA模板的存在,先用HA基因的小片段引物(300bp)进行扩增,呈阳性之后才做的大片段(1700bp)扩增。图1为我做的退火温度梯度的图片,在D,G泳道出现了明显的目的条带,但是E泳道不知道是什么东西。

但是在确定好的条件下,再用样本进行PCR扩增是,没有目的条带出现,而呈现出图2这种情况。不知道这种情况为什么东西导致的,求教。。(为什么同样的反应条件,试剂也是一样的,则出现完全没有目的条带呢)

在找不到原因的情况下,我又重新抽提了RNA,并且也做了短片段的扩增,没有问题之后。用保真酶来扩增大的片段,则呈现出了以下的情况,求解答。


小弟在此求教,急啊。赶着毕业啊,请大家多多指点,拜谢了

为退火温度优化






保真酶的扩增图片
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dart512

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xy19860508(金币+10): 2012-02-25 12:25:26
wanhscn(金币+5, MolEPI+1): 很好!欢迎继续解答,必要时将授予专家指数! 2012-02-25 15:56:57
xy19860508: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-04 12:10:31
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xy19860508

铜虫 (小有名气)

xy19860508

铜虫 (小有名气)

dart512

铜虫 (正式写手)

我恨回锅肉

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-05-02 13:37:25
xy19860508: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-04 12:10:18
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