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NdeI,BamHI双酶切
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| 我用NedI和BamHI双酶切我的目的片段然后和28a连接。试着改变了多次酶切酶连条件,但一直都转化不出来。28a切完后跑电泳与质粒比较应该是切开的。现在不知道问题到底是出在哪里了。求各位帮忙分析一下,可能的原因以及解决的方案吧~谢谢~~感激不尽! |
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4楼2013-08-15 14:48:07
gyesang
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2楼2013-08-14 18:06:44
hermain
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7楼2013-08-15 15:39:22
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1、用通用缓冲液进行双酶切,酶量不可太多,例如2~3mL培养过夜菌体,Kit提取质粒用40uLDDW洗脱下来,可加NdeI 2~3U,BamHI 1~2U,混匀后37℃,酶切1.5h即可,酶量不能太多,酶切时间不宜太长; 2、胶回收不要用低熔点琼脂糖,譬如用Agarose H,胶浓度用0.5%,胶长度~15~20cm(可将常用的两灌胶槽用胶带串接在一起),准备冷冻的电极缓冲液中间更换缓冲液,或冻制缓冲冰块,中间加入冷却,电压用120~140V,电泳时间~1.5-2.5h,注意除了电Marker样品外,还带上未酶切的载体样作对比; 3、用常规胶回收试剂盒回收,熔胶稳定控制在50℃左右,6~10mins,柱中目标片段用30uL水洗脱下来,一定要电泳检视,取3~5ul点样,应该条带清晰,无降解和聚集等杂带; 4、待插入的双酶切目标基因按常规操作,最后回收样也要电泳检视质量可靠后,再与载体连接。 |
8楼2018-11-19 09:52:27
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1.如果你有含插入基因(最好大于1kb,愈大更好)的pET类载体,还可再用NdeI/BamHI双切则比较方便,直接用NdeI/BamHI双切,低浓度加长胶电泳可回收到酶切好的高质量的pET-NdeI/BamHI备用载体;若只有原始载体,因为NdeI或BamHI均不能保证100%切开,特别NdeI大致只有70%,因此你双酶切的载体中大致有30%的载体仅仅是完成单切,因此你的载体再连接时,相当于连接液中原始载体特别高,而目的连接载体不多,需要筛选比较多的克隆才可能筛选到你的目标克隆; 2.其次,由于插入用载体质量差,连接时还是按连接说明书中载体/基因=1:5的比例,那么合格的连接所占比例就非常低,转化筛选自然困难;此时可用可用1:1或2:1比例; 3.NdeI的保护碱基比较特别,可在百度中输入“限制性内切酶保护碱基”,可查找到有关保护碱基设计的文章参考,不然你的插入基因根本就没有NdeI粘端,自然连接转化不成功; 4.感受态质量可通过平行用未酶切的载体作为对照,应该长出很多阳性克隆,若对照都没长,自然表明感受态不好; 5.电转化时,由于多数时候用的都是反复使用的旧电转杯,而电极铝片氧化严重,再按常规电转参数自然效率不高,可用细砂纸打磨下电极除掉氧化层,外侧方便打磨,内侧可将砂纸裁成小条,用硬薄片物顶住轻轻打磨好,再用DDW冲洗干净,超净工作台内紫外灯照射并吹干后再用。 6.若你的实验室不差钱,对于用pET原始载体进行双酶切的操作可再酶切1.5h后加入碱性磷酸酶(如FastAP)进行脱磷酸处理,65℃灭活后再胶回收,连接时比例用载体/基因=1:1比例连接,再转化。 祝你实验顺利! |
9楼2018-11-19 10:21:04













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