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XI4ZHL

铜虫 (著名写手)

[求助] 双酶切,体系,切不出来

各位虫友,我在构建载体是,用Hind III和sac2进行双酶切,怎么切不出来,怎么设计体系好?怎么做才能做出来啊? 我是先提质粒和扩出目的片段(加了酶切位点),然后根据说明书双酶切,纯化,连接,转化,涂板,挑菌,最后做了pcr,可是没有目的带!我该怎么弄比较好!!求各位虫友,给我想想办法吧!小弟不胜感激,谢谢!!!说明书中的体系是水16   buffer2  酶分别0.5  dna 1。还有连接反应说是质粒20-100ng DNA是1:1to5:1,我不知道我的浓度,就加了1ul的质粒,5ul的DNA !
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【分子生物】EPI帖

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心,是用来使用的,不能搁浅!
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XI4ZHL

铜虫 (著名写手)

我的酶切是在37度过夜,涂板也有菌生长是怎么回事,我用的是peGFP-N1,抗卡那,加了卡那怎么还长菌,是转进去了空质粒吗??
心,是用来使用的,不能搁浅!
2楼2011-09-26 21:57:32
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yidC423R

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-09-27 07:36:03
XI4ZHL(金币+1): 2011-09-28 11:36:13
too many possibilities. How many nucleotides did you put outside the cutting side? how do you make sure the cutting is 100%? have you checked the DNA conc after the PCR & purification? have you set up a neg control for the ligation? you have to know the conc of both fragments for the ligation. there are so many problems in your experiment.
3楼2011-09-26 22:20:51
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瓶儿花

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, MolEPI+1): 最近很活跃啊,鼓励加鼓励 2011-09-27 07:36:32
XI4ZHL(金币+2): 2011-09-28 11:36:21
1.要做连接的话,反应体系要扩大到40μL.
质粒 20μL
限制性内切酶 各2μL
Buffer    4μL
双蒸水   补足到40μL
37℃反应2h以上。
2.你的质粒加的太少了,浓度太低。
3.你的目的产物说是有设计酶切位点,那酶切位点有加保护碱基吗?有些酶切位点不加保护碱基,PCR产物直接酶切是切不动的,建议你连到T载体上再酶切。
4.你的实验没有加对照,你的载体酶切,你不能确定酶切是否完全,所以对照是必须的。
对照组:
酶切后的载体  1μL
10×T4 DNA ligase Buffer  1μL
T4 DNA ligase   1μL
双蒸水   up to 10μL
与实验组一起转化涂布抗性平板,看长出来的菌落多少,如果很多的话,说明你酶切不完全,要重新做过。
4楼2011-09-26 23:44:10
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nach

铜虫 (著名写手)

不让吃就去死

260nm分光测一下浓度 挺容易的
不让吃就去死
5楼2011-09-27 00:56:32
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

建议质粒送去测一下序,主要是酶切位点附近的序列,一看就知道怎么回事了
6楼2011-09-27 06:18:39
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XI4ZHL

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yidC423R at 2011-09-26 22:20:51:
too many possibilities. How many nucleotides did you put outside the cutting side? how do you make sure the cutting is 100%? have you checked the DNA conc after the PCR & purification? have you ...

这些问题我都没做,我第一次做这个实验,实验室也没做到,你能不能给我详细说说都有哪些步骤啊,谢谢,能用汉语回答吗,看英语有点吃力,谢谢
心,是用来使用的,不能搁浅!
7楼2011-09-27 17:38:08
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XI4ZHL

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 瓶儿花 at 2011-09-26 23:44:10:
1.要做连接的话,反应体系要扩大到40μL.
质粒 20μL
限制性内切酶 各2μL
Buffer    4μL
双蒸水   补足到40μL
37℃反应2h以上。
2.你的质粒加的太少了,浓度太低。
3.你的目的产物说是有设计酶切位点, ...

那我在双酶切时,目的基因是不是也要扩大到40ul,
也是  20ul目的基因
限制性内切酶各 2ul
buffer 4ul
双蒸水到 40ul
也是这样吗?
那做链接时,质粒 和目的基因加多少好啊?
我的没保护碱基,我尽快设上
谢谢
心,是用来使用的,不能搁浅!
8楼2011-09-27 17:56:49
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XI4ZHL

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cdl007 at 2011-09-27 06:18:39:
建议质粒送去测一下序,主要是酶切位点附近的序列,一看就知道怎么回事了

是没有酶切的质粒送去测序吗?测序的目的是什么啊,质粒的序列我都知道,能详细说说嘛,谢谢
心,是用来使用的,不能搁浅!
9楼2011-09-27 17:58:10
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

XI4ZHL(金币+2): 2011-09-28 11:36:43
没有切出来的质粒测序,

目的是看连接的对不对

不是为了测质粒序列,通常出错都在酶切位点
10楼2011-09-27 18:03:09
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