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大脸猫猫喵

金虫 (初入文坛)

[求助] NdeI,BamHI双酶切

我用NedI和BamHI双酶切我的目的片段然后和28a连接。试着改变了多次酶切酶连条件,但一直都转化不出来。28a切完后跑电泳与质粒比较应该是切开的。现在不知道问题到底是出在哪里了。求各位帮忙分析一下,可能的原因以及解决的方案吧~谢谢~~感激不尽!
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hxd2002

新虫 (初入文坛)

1、用通用缓冲液进行双酶切,酶量不可太多,例如2~3mL培养过夜菌体,Kit提取质粒用40uLDDW洗脱下来,可加NdeI 2~3U,BamHI 1~2U,混匀后37℃,酶切1.5h即可,酶量不能太多,酶切时间不宜太长;
2、胶回收不要用低熔点琼脂糖,譬如用Agarose H,胶浓度用0.5%,胶长度~15~20cm(可将常用的两灌胶槽用胶带串接在一起),准备冷冻的电极缓冲液中间更换缓冲液,或冻制缓冲冰块,中间加入冷却,电压用120~140V,电泳时间~1.5-2.5h,注意除了电Marker样品外,还带上未酶切的载体样作对比;
3、用常规胶回收试剂盒回收,熔胶稳定控制在50℃左右,6~10mins,柱中目标片段用30uL水洗脱下来,一定要电泳检视,取3~5ul点样,应该条带清晰,无降解和聚集等杂带;
4、待插入的双酶切目标基因按常规操作,最后回收样也要电泳检视质量可靠后,再与载体连接。
8楼2018-11-19 09:52:27
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
大脸猫猫喵: 金币+1, 有帮助, 这个都是做过的,都是没有问题的~ 2013-08-14 18:25:09
有没有做阳性对照(转pET28a空载体)来排除你平板抗性没用错和感受态细胞良好
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-08-14 18:06:44
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hermain

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
大脸猫猫喵: 金币+1, 有帮助, 我分步酶切试过的,但还是不行。我感觉可能是我的目的蛋白二级结构上的问题,但这方面我不懂,也不知道怎么样处理。 2013-08-15 13:54:49
目的片段切下来以后跑电泳看过了吗?有可能是双酶切不完全。NedI和BamHI双酶切的切割效率可能比较低,要不就用分步酶切的方法试一试。
3楼2013-08-15 13:35:40
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cookee1981

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-15 16:47:25
gyesang: 回帖置顶 2013-08-15 16:47:37
gyesang: 很好的建议,楼主可以考虑 2013-08-15 16:53:39
你的目的片段是PCR产物还是已经连在了克隆载体上?如果是直接用PCR产物进行酶切,可能会比较困难,而且要看你有没有在酶切位点两端加上保护碱基。如果是从克隆载体上双酶切,那就要测序检查一下酶切位点是否为唯一的在目的片段两端。
4楼2013-08-15 14:48:07
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