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MS
LAMMPS/DL_POLY
Gromacs/Amber/NAMD
DS/Sybyl/Autodock
Monte Carlo
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hs18166zd58
2026-01-14
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MS
]
大家好,我是新手,多多关照。。。
(评阅+6)
(0/152)
zzb19920328
2014-03-19
2014-03-19 19:40:32
by
zzb19920328
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其他
]
求SYBYL-X1.3版含有license的
(0/448)
米羰20
2014-03-18
2014-03-18 16:25:05
by
米羰20
[
MS
]
为什么同样的设置,计算出的结果有时会相差很大呢?
(评阅+1)
(8/1395)
upc穆宁
2014-03-14
2014-03-15 22:59:00
by
huachao90
[
LAMMPS/
]
lammps报错
(评阅+1)
(0/448)
dahuchang
2014-03-15
2014-03-15 13:26:07
by
dahuchang
[
MS
]
分子动力学计算方面的培训有没有
(评阅+1)
(6/1188)
学员nBUFFa
2014-03-14
2014-03-14 16:52:27
by
smutao
[
MS
]
Mg(0001)为什么后面是四个数?不是只有h、k、l三个嘛?
(评阅+1)
(19/2683)
lishufei
2011-05-12
2014-03-12 23:38:23
by
yingying1588
[
MS
]
用MS怎样搭建Al20O30的结构啊?
(评阅+6)
(3/608)
杨韫13
2014-03-05
2014-03-12 10:32:15
by
杨韫13
[
MS
]
求个氢气原子往TC4钛合金里高温高真空扩散的模型
(评阅+6)
(0/307)
ansysabaqus
2014-03-12
2014-03-12 09:29:06
by
ansysabaqus
[
MS
]
如何计算水的介电常数,公式中的偶极矩怎么计算
(评阅+1)
(20/3694)
雨日的晴天
2014-03-05
2014-03-11 13:23:10
by
ytudou
[
MS
]
有人使用ADF软件吗
(评阅+1)
(0/661)
潇湘小虎
2014-03-11
2014-03-11 09:44:48
by
潇湘小虎
[
Gromacs
]
gromacs可以做空间分布函数(spatial distribution function)吗
(4/1693)
mengsk
2013-04-20
2014-03-11 07:24:06
by
是_非
[
Hyperch
]
hyperchem可以计算结合能吗?
(评阅+6)
(2/898)
姜志文
2014-02-23
2014-03-10 17:52:16
by
姜志文
[
Gromacs
]
NAMD在Ubantu系统运行老是死机
(评阅+1)
(0/443)
229231168
2014-03-10
2014-03-10 09:13:52
by
229231168
[
DS/Syby
]
把分子pdb文件修改后无法使用
(
1
2
)
(评阅+6)
(17/1847)
姜志文
2014-02-28
2014-03-08 13:38:36
by
姜志文
[
MS
]
[关贴]
求各位指点。
(评阅+6)
(3/318)
992648352
2014-03-07
2014-03-07 13:12:05
by
pigrass
[
LAMMPS/
]
求助:lammps非周期边界
(
1
2
3
)
(评阅+6)
(22/4565)
ysshj
2013-12-24
2014-03-06 11:49:45
by
ysshj
[
其他
]
【求助】ligplot 怎么确定残基范围?
(评阅+1)
(8/2073)
houxuben
2010-12-28
2014-03-05 10:31:21
by
刘建君青科大
[
资源
]
【原创】关于MS的资料。
(
1
2
)
(评阅+2)
(16/1904)
李学忠
2011-04-07
2014-03-05 06:35:09
by
songmengyan
[
Gromacs
]
【求助】打算从amber学起
(
1
2
)
(16/2502)
flyover08
2010-09-05
2014-03-04 20:50:37
by
iamthinking
[
DS/Syby
]
【求助】关于sybyl中配体分子的电荷问题
(3/1082)
qinqin837
2010-04-28
2014-03-04 17:13:40
by
anyachan
[
LAMMPS/
]
使用fix move 命令后出现警告是正常的么?
(评阅+1)
(2/1334)
weizhiyong
2014-02-12
2014-03-02 12:28:40
by
weizhiyong
[
LAMMPS/
]
模拟和实验如何结合在一起?
(评阅+1)
(23/1604)
jane8556
2013-12-24
2014-03-01 20:39:14
by
xiejf
[
DS/Syby
]
de novo evolution用的片段库一般都去哪能找到啊
(2/972)
molinsky
2012-07-17
2014-03-01 16:31:57
by
netkiller119
[
专家会诊
]
[关贴]
请问有用xmd做分子动力学模拟的大神没?恳请各位大侠指点。
(评阅+6)
(0/793)
巧帅之风
2014-03-01
2014-03-01 13:14:57
by
巧帅之风
[
LAMMPS/
]
现有EAM势函数具体参数如下,还有其他势函数具体参数么?开此贴供大伙交流
(2/1076)
御剑江湖
2011-10-31
2014-02-28 11:28:21
by
巧帅之风
[
MS
]
同源建模之----分别建模
(7/2812)
学员qhVMrx
2012-05-19
2014-02-27 06:57:42
by
zhen_fang
[
DS/Syby
]
【求助】GOld 共价对接
(5/2075)
zxl102623
2010-09-28
2014-02-26 08:08:15
by
飘落的丘陵
[
MS
]
[关贴]
单个振动模的偶极矩
(评阅+1)
(0/316)
chunxiang
2014-02-24
2014-02-24 22:30:09
by
chunxiang
[
其他
]
amber的小问题
(评阅+1)
(1/669)
请国米与
2014-02-24
2014-02-24 19:47:37
by
meatball1982
[
Monte C
]
【求助】氢气的逸度计算
(7/1772)
zhuna325
2011-04-12
2014-02-23 16:01:14
by
lvluohua929
[
Monte C
]
simbad/simspud 及溅射模拟的讨论
(评阅+1)
(21/964)
ssjjleo
2013-10-28
2014-02-20 16:59:56
by
ssjjleo
13X 分子筛结构优化,吸附等温线
(6/2094)
水晶蚂蚁
2012-07-13
2014-02-20 14:22:42
by
红薇染露
[
Gromacs
]
AMBER力场 improper 参数 在NAMD中不能被读入(0 IMPROPER)
(评阅+1)
(4/1335)
vip_zzc
2014-02-18
2014-02-18 21:22:52
by
vip_zzc
[
其他
]
在VMD中如何把分子构型存成图片格式
(5/26928)
ylzhao
2013-02-21
2014-02-17 12:24:50
by
心菲馨晨
[
其他
]
<转载>如何撰写计算机软件专利
(评阅+1)
(0/4736)
fishhope
2014-02-12
2014-02-12 08:12:05
by
fishhope
[
MS
]
MS软件计算聚合物cell自由体积
(评阅+1)
(16/1832)
staventchoke
2014-02-10
2014-02-11 10:09:04
by
wangzhikun
[
专家会诊
]
pull命令
(评阅+2)
(3/412)
3115321
2014-01-23
2014-02-03 17:31:36
by
QQ_Q_Q_QQ
[
专家会诊
]
QM/MM、QM+MM、ONIOM三者之间的区别
(评阅+1)
(3/3086)
broken1999
2014-01-13
2014-01-29 16:18:40
by
虫虫pig
[
Gromacs
]
请大神指点用分子动力学软件模拟金属离子(主要是汞、砷等元素)在水溶液中的结构
(评阅+1)
(1/950)
commandow
2014-01-27
2014-01-29 09:29:45
by
smutao
[
其他
]
【求助】pymol的LINUX安装问题,装过的请留步~
(评阅+1)
(4/2101)
绿茶QJM
2010-12-14
2014-01-28 11:26:02
by
dongming1983
[
DS/Syby
]
autodock 配体文件在windows下提取
(评阅+1)
(4/1329)
___garrett
2014-01-05
2014-01-23 22:12:58
by
yangming98
[
DS/Syby
]
【求助】autodock结果怎么分析 还有怎么来进行筛选
(
1
2
)
(评阅+1)
(12/3693)
唐荣胜
2010-05-25
2014-01-23 19:16:50
by
yangming98
[
CPMD/CP
]
【讨论】CPMD中多温度点的设置
(7/1615)
lixf
2010-08-28
2014-01-19 12:34:13
by
hufeng
[
其他
]
蛋白质三级结构结构模建
(评阅+1)
(3/1319)
黑藻先生
2014-01-18
2014-01-19 00:45:05
by
黑藻先生
[
LAMMPS/
]
NI/CU两相薄膜或者纳米线单拉的屈服应力是要大于纯NI的么?
(评阅+1)
(1/465)
lx_PICO
2014-01-18
2014-01-18 22:18:13
by
kiss20085537
[
CPMD/CP
]
CPMD中用NOSE控温法温度远离目标怎么办
(评阅+1)
(4/756)
voleyes
2013-11-19
2014-01-18 11:34:52
by
hufeng
[
MS
]
聚苯乙烯链的模拟
(评阅+1)
(5/1164)
ammytao
2014-01-16
2014-01-17 09:57:05
by
mzhyan
[
Gromacs
]
有没有大牛总结一下分子模拟需要准备哪些参数以及如何准备
(评阅+1)
(1/361)
jackymiao
2014-01-08
2014-01-16 19:16:44
by
nature31
[
MS
]
[关贴]
求助
(评阅+1)
(0/207)
风铃儿0608
2014-01-15
2014-01-15 09:41:53
by
风铃儿0608
[
Gromacs
]
请问各位前辈,能不能在Gromacs中使用dreiding force field?
(评阅+1)
(4/1130)
小溪yy潺潺
2014-01-14
2014-01-14 16:15:41
by
小溪yy潺潺
[
专家会诊
]
求助一句话翻译
(评阅+1)
(2/936)
哀兵必胜
2013-12-27
2014-01-14 04:23:36
by
wjmed
[
CPMD/CP
]
CPMD 3.17.1 新版更新与与ubuntu + gcc4.6 + openmpi并行编译
(评阅+8)
(3/2059)
ChemiAndy
2013-09-05
2014-01-13 18:58:03
by
一声叹息010
[
ME/Gulp
]
GULP计算molecular cluster的态密度怎样得到平滑曲线(更多的数据点)
(10/785)
curieshicy
2014-01-12
2014-01-12 18:10:33
by
miaojiabing
[
MS
]
MS5.5分子模拟安装出现问题,紧急求助
(评阅+1)
(8/886)
故事是这样的
2014-01-08
2014-01-11 00:14:36
by
茹此无声
[
LAMMPS/
]
DL_POLY Classic下载方法
(评阅+1)
(0/590)
dreamfly_ykf
2014-01-09
2014-01-09 17:24:33
by
dreamfly_ykf
[
专家会诊
]
多晶石英的模型求助!
(评阅+1)
(0/258)
moirakaola
2014-01-09
2014-01-09 10:35:11
by
moirakaola
[
DS/Syby
]
【求助】在Syble中用COMSIA法计算分子的Acceptor和Donor数值为零是怎么回事?
(评阅+1)
(9/1886)
serien1987
2010-10-25
2014-01-09 07:34:34
by
gcg624
[
Gromacs
]
有人搞gmx分析部分的编程么
(评阅+1)
(41/1528)
little_lion
2014-01-03
2014-01-06 22:30:21
by
天涯sx
[
Gromacs
]
有用天津超算跑NAMD的虫子吗?
(评阅+1)
(0/331)
smutao
2014-01-04
2014-01-04 16:04:53
by
smutao
[
MS
]
[关贴]
碳纳米管MD模拟中积分时间步长选取时存在的问题
(评阅+1)
(15/2415)
newhoperoad
2014-01-03
2014-01-03 22:29:29
by
newhoperoad
[
MS
]
MS分子模拟计算效率
(评阅+1)
(7/1582)
zs806750658
2013-12-31
2014-01-03 11:13:44
by
笑笑愁
[
DS/Syby
]
【求助】ADT打开有问题
(7/1781)
银光闪烁
2010-05-18
2014-01-03 09:39:24
by
joy11
[
资源
]
Benchware 3D Explorer哪里可以下载?
(评阅+1)
(3/710)
哀兵必胜
2013-12-29
2014-01-01 18:47:07
by
xuxm03
[
Gromacs
]
交流一下c语言或者Fortran语言怎么应用于namd中
(11/1145)
cuiyoutian88
2011-11-01
2013-12-31 14:35:53
by
小星星诶zhx
[
Gromacs
]
【其他】NAMD
(评阅+1)
(2/445)
zhang727626
2010-11-02
2013-12-31 11:38:16
by
小星星诶zhx
[
LAMMPS/
]
LAMMPS人气挺高啊
(评阅+1)
(0/299)
hakuna
2013-12-31
2013-12-31 08:40:48
by
hakuna
[
其他
]
【求助】ms软件的加电场的一个问题,有知道的说一下,非常感谢
(评阅+1)
(6/1578)
zqqdqq123
2010-05-10
2013-12-31 05:57:10
by
anmin0127
[
其他
]
关于高分子的分子动力学模拟软件
(评阅+1)
(3/1335)
breathwave
2013-12-26
2013-12-31 03:08:13
by
lsloneil
[
DS/Syby
]
autodock做了100个结果,之后该怎么处理,结合的是位点I,求助啊。。。
(评阅+1)
(4/1145)
zxw9301
2013-12-30
2013-12-30 19:36:55
by
longytu
[
Monte C
]
[关贴]
刚开始学习C语言的编程,用的是蒙特卡罗法,请大家指点一下
(评阅+1)
(1/1121)
qinjianfa
2013-12-26
2013-12-27 09:17:11
by
sciencejoy
[
Gromacs
]
分子动力学投稿咨询
(评阅+1)
(4/1185)
蓝洛水seven
2013-12-04
2013-12-26 10:50:16
by
zhqchs
[
其他
]
蛋白加电荷
(评阅+1)
(6/414)
huantao12
2013-12-23
2013-12-25 11:56:52
by
huantao12
[
MS
]
MS模拟气体在纳米管或狭缝中流动
(评阅+1)
(0/203)
suihg
2013-12-25
2013-12-25 11:34:35
by
suihg
[
DS/Syby
]
【讨论】同一蛋白质分成不同部分建模得到的结构如何生成一个结构?
(9/2113)
zhangdagou5858
2010-05-31
2013-12-24 12:00:03
by
shuifen1108
[
其他
]
大家注意啦!关于分子模拟论坛。。。。
(0/291)
周_周
2013-12-24
2013-12-24 11:38:51
by
周_周
[
ME/Gulp
]
ME 中算出来的焓值是什么焓
(2/495)
Fly_2010
2012-04-16
2013-12-23 16:11:28
by
jiafeimao236
[
Gromacs
]
【求助】如何对轨迹文件取平均构象
(评阅+1)
(4/1193)
jhonsmith001
2010-10-15
2013-12-21 12:44:28
by
菲常亦可
[
Gromacs
]
蛋白跑出水盒子外边了
(评阅+1)
(9/2963)
qingtian510
2013-11-21
2013-12-18 20:18:10
by
29050801
[
ME/Gulp
]
【求助】平衡态判断
(2/402)
thhust
2010-05-05
2013-12-18 12:20:33
by
wanggulu
[
DS/Syby
]
【求助】Discovery Studiov2.1 和Accelrys Pipline Pilotv7.5兼容吗?
(
1
2
)
(评阅+1)
(11/1694)
xppcomeon
2010-09-28
2013-12-17 07:37:11
by
asind
[
其他
]
[关贴]
autodock
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huantao12
2013-12-16
2013-12-16 14:48:12
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huantao12
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DS/Syby
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一个小小的困惑,sybyl
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老曼7
2013-12-14
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yalefield
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LAMMPS/
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关于计算平均能量
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wangyisheng
2013-12-09
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wangyisheng
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其他
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分子动力学研究领域的又一重要进展
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yexuqing
2011-07-25
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sciencejoy
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Gromacs
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分子模拟投中国生物医学工程学报
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蓝洛水seven
2013-12-09
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hanhan1020
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MS
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阴离子与氢键相互作用模拟
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staventchoke
2013-12-07
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ohcesc
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CPMD/CP
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CPMD怎么得到周期性的轨迹文件?
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voleyes
2013-11-30
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vallen
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MS
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MS中如何将一个体系按一定速率升温
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BlackArcher
2013-11-29
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BlackArcher
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Monte C
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【转帖】动力学蒙卡方法(KMC)模拟薄膜生长的基本知识
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zyj8119
2010-09-11
2013-12-04 17:46:47
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奈落之夜
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Gromacs
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蛋白质动力学模拟有什么中文核心可以投呀。
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wanglang1987
2013-06-17
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wanglang1987
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LAMMPS/
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Lz分子动力模拟中怎么找到原子间的势能
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Ballendtoo
2013-11-27
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ddll_slsl
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MS
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polymer 初始结构
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linyusuc
2013-11-20
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linyusuc
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DS/Syby
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请教审稿人这句话想说什么意思呢?我该如何回答(同源建模方面)
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kingstar1027
2013-11-30
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kingstar1027
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MS
]
改变盒子尺寸后,模拟出现的问题
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tim562944200
2013-11-28
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tim562944200
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【求助】石墨烯的结构
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baoyan
2010-07-05
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QiangLv1991
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专家会诊
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闲来无事,玩儿了个MD,得到这样的结果合理么
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hakuna
2013-11-25
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MS
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菜鸟求助 关于电子迁移
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茶味果冻
2013-11-27
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茶味果冻
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【求助】materials studio软件中 哪里可以设置压力啊
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hbywl
2010-06-02
2013-11-26 19:00:46
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white雪儿
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分子动力学能量守恒的相关问题
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gasam
2013-11-21
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gasam
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MS
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弛豫过后粒子在模拟盒子中的分布
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tim562944200
2013-11-25
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tim562944200
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