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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock做了100个结果，之后该怎么处理，结合的是位点I，求助啊。。。
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zxw9301

金虫 (初入文坛)

[交流] autodock做了100个结果，之后该怎么处理，结合的是位点I，求助啊。。。 已有2人参与

autodock做了100个结果，之后该怎么处理，结合的是位点I，求助啊。。。
或者是用pymol怎么解释和显示周围的氨基酸残基，选择哪个构象比较好？？？？
大家给点意见，实验室就我一个做这个方向，没人交流，痛苦啊。。。。
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1楼 2013-12-30 15:56:51
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smutao

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
2楼2013-12-30 17:09:32
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zxw9301

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2013-12-30 17:09:32
能详细描述下么

就是显示药物小分子对接后周围的氨基酸残基用什么办法？
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3楼2013-12-30 18:16:24
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-31 16:37:21
本帖内容被屏蔽
4楼2013-12-30 18:19:42
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+2, 感谢指导。 2013-12-31 16:37:26
1：构象首选能量最小的构象，按照能量打分，其次可以考虑100次中出现构象次数最多的构象
2：显示周围的残基，autodock里面有show interaction的功能
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5楼2013-12-30 19:36:55
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