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zxw9301

金虫 (初入文坛)

[交流] autodock做了100个结果,之后该怎么处理,结合的是位点I,求助啊。。。已有2人参与

autodock做了100个结果,之后该怎么处理,结合的是位点I,求助啊。。。
或者是用pymol怎么解释和显示周围的氨基酸残基,选择哪个构象比较好????
大家给点意见,实验室就我一个做这个方向,没人交流,痛苦啊。。。。
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smutao

禁虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-31 16:37:21
本帖内容被屏蔽

4楼2013-12-30 18:19:42
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zxw9301

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2013-12-30 17:09:32
能详细描述下么

就是显示药物小分子对接后周围的氨基酸残基用什么办法?
3楼2013-12-30 18:16:24
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+2, 感谢指导。 2013-12-31 16:37:26
1:构象首选能量最小的构象,按照能量打分,其次可以考虑100次中出现构象次数最多的构象
2:显示周围的残基,autodock里面有show interaction的功能
5楼2013-12-30 19:36:55
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