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请国米与

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[交流] amber的小问题

我从amber网站下载了pdb文件后，如何生成inpcrd和prmtop文件呢？
pdb文件保存在windows系统里，那么服务器如何调用这个pdb文件啊，求大神解释。

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1楼 2014-02-24 17:02:05

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meatball1982

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请国米与: 金币+5 2014-02-25 21:33:47

如何生成inpcrd和prmtop可以看amber官网的tutorial
http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial1/
这里说的很清楚，还是官方的。

pdb文件保存在windows系统里，那么服务器如何调用这个pdb文件啊，求大神解释
你有服务器，用你的账号进入，把你的pdb 文件upload 上去，用SSHSecureShellClient，我用的是这个，然后按官网的操作练习一下就行，如果在linux如何操作还不熟，就找本书看看基本操作。鳥哥的 Linux 私房菜是个不错的选择。

[ Last edited by meatball1982 on 2014-2-24 at 19:49 ]

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