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请国米与

金虫 (著名写手)


[交流] amber的小问题

我从amber网站下载了pdb文件后,如何生成inpcrd和prmtop文件呢?
pdb文件保存在windows系统里,那么服务器如何调用这个pdb文件啊,求大神解释。
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meatball1982

铜虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请国米与: 金币+5 2014-02-25 21:33:47
如何生成inpcrd和prmtop可以看amber官网的tutorial
http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial1/
这里说的很清楚,还是官方的。

pdb文件保存在windows系统里,那么服务器如何调用这个pdb文件啊,求大神解释
你有服务器,用你的账号进入,把你的pdb 文件upload 上去,用SSHSecureShellClient,我用的是这个,然后按官网的操作练习一下就行,如果在linux如何操作还不熟,就找本书看看基本操作。鳥哥的 Linux 私房菜是个不错的选择。

[ Last edited by meatball1982 on 2014-2-24 at 19:49 ]
2楼2014-02-24 19:47:37
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