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转基因猴子

木虫 (正式写手)

[交流] Gromacs运算结束后如何提取某指定模拟时间的蛋白质结构?

各位,我做完了50ns的运算,现在想提取某些模拟时间节点的蛋白质结构gro或者pdb文件,请问用什么命令提取呢?
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我还年轻,我要上路!
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2楼2014-03-24 15:39:02
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fangsteel

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-24 19:16:03
用vmd输入xtc直接跑到指定某个时刻的构象,然后导出pdb就行。
gromacs
3楼2014-03-24 16:01:35
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
转基因猴子: 金币+8, 看的时候貌似直接略过这个命令了 2014-03-24 16:23:02
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-24 19:16:09
RTFM  : http://zh.wikipedia.org/wiki/RTFM


trjconv  : is ok!
4楼2014-03-24 16:13:09
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