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autodock 配体文件在windows下提取
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根据网上教程，我已经安装了cygwin，并且把cygwin的bin文件夹放到了windows环境变量里。 第一步提取所有的pdbqt信息： grep '^DOCKED' my_docking.dlg | cut -c9- > my_docking.pdbqt 第二步将pdbqt格式转化为pdb格子，也就是删去电荷和atomtype的两列数据： cut -c-66 my_docking.pdbqt > my_docking.pdb 之后咋弄，求帮助。 之后还有没有了，我咋弄不明白了。 蛋已碎啊！！！！！！ |
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2楼2014-01-05 19:05:55
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月只蓝: 金币+2, 鼓励交流 2014-01-12 09:19:11
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的确是个没有弄清楚的问题，你到底是想查看结果还是分析结果？查看结果Autod自带的MGLTools就行。 作图分析则pymol 等都好。 PS：现在的Autodock MGLTools根本不需要安装什么cywin了。 关于autodock vina结果的查看，可以见这里 http://bioms.org/forum-simulate_visualization-1.html 关于Autodock和vina的使用可以见这里http://bioms.org/forum-autodock_vina-1.html |
4楼2014-01-11 19:42:20
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