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qinqin837

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于sybyl中配体分子的电荷问题 已有2人参与

请问,配体分子中有……N(+)——O(-)这样的带电原子,在sybyl中怎么处理啊,直接在氧上加一个氢是不是就改变配体的性质?这样对对接和COMFA是不是有影响?
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我的ID叫qinqin837,但我不是83年7月生的哦,我没那么大……
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sjsjsj2007

金虫 (著名写手)

★
qinqin837(金币+1):谢谢参与
我也是刚刚处理这些分子,遇到的,正在困惑,希望大牛解答,等待呀
2楼2010-04-29 21:52:30
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
qinqin837(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-30 08:38
我的理解,需要用高斯来解决这个问题。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2010-04-29 22:01:16
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anyachan

木虫 (小有名气)

★
qinqin837(金币+1): 谢谢参与
不知这位姐姐还在做这方面的工作吗?我在分子对接时小分子中有羧基或者磷酸基团时不知道电荷怎么处理,不知能不能指教
4楼2014-03-04 17:13:40
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