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分子动力学模拟的问题
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2013-05-12 21:38:13
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childsliu
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专家会诊
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sybyl对接分子后,发现分子中的卤素原子没显示是什么原因呀,谢谢了
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惟精惟一
2013-05-11
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惟精惟一
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ME/Gulp
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njn0516
2013-05-11
2013-05-11 08:00:56
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njn0516
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Gromacs
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amber动力学模拟
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qingxueer
2013-01-13
2013-05-08 15:44:28
by
Twitter
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LAMMPS/
]
lammps在windows下的并行问题
(0/645)
rabbitllp
2013-05-06
2013-05-06 12:19:23
by
rabbitllp
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LAMMPS/
]
read_dump运行报错
(1/1002)
luomia
2013-04-23
2013-05-03 13:08:00
by
ddll_slsl
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MS
]
怎么将高斯优化好的氨基酸分子导入到金属表面进行模拟
(2/515)
酱油Y
2013-04-28
2013-05-03 10:39:25
by
酱油Y
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其他
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Nose-Hoover模拟的NVT系综为什么动能波动这么大?
(0/1680)
chenjingzhi
2013-05-02
2013-05-02 21:59:06
by
chenjingzhi
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专家会诊
]
请问各位前辈,可用于Window系统的全新药物设计有哪些软件啊?谢谢了啊
(5/994)
蓄势01
2013-04-20
2013-05-01 22:54:27
by
yalefield
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MS
]
有没有研究过团簇表面能的啊,可以聊聊自己的经验
(1/495)
Lzp425496024
2013-04-26
2013-04-28 10:15:51
by
Lzp425496024
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LAMMPS/
]
颗粒势场gran/hertz/history参数设置
(0/466)
frankying
2013-04-28
2013-04-28 09:07:51
by
frankying
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其他
]
HEX蛋白对接问题求助
(4/1362)
autodockytu
2013-04-24
2013-04-27 15:19:26
by
ansolar
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DS/Syby
]
用DS跑分子动力学,想购买一台workstation如下,请给意见谢谢
(7/1790)
leirongjian
2013-04-07
2013-04-27 08:19:22
by
mingzezhong
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Gromacs
]
TIP3P 和 SPC/E 适用的体系
(7/2010)
mengsk
2013-02-26
2013-04-26 22:09:11
by
fhh2626
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DS/Syby
]
请教高手关于蛋白质分子对接问题,先拜谢了
(4/854)
yusuya
2012-09-13
2013-04-26 07:13:37
by
小科研女dow
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MS
]
自扩散系数
(3/429)
风雨无情8581
2013-04-24
2013-04-25 20:30:04
by
haixiawu
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MS
]
如何将P1结构再变为周期性结构
(0/724)
upc穆宁
2013-04-25
2013-04-25 10:50:55
by
upc穆宁
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专家会诊
]
精氨酸中氮原子的杂化状态
(3/714)
wl507586
2013-04-22
2013-04-24 21:55:53
by
jjlex
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MS
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material studio 5.0 安装后开机出现lmgrd.exe应用程序错误
(3/768)
ltxiaoying
2013-04-23
2013-04-24 16:46:14
by
Lzp425496024
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LAMMPS/
]
lammps中怎么设置冷却速度
(4/1633)
yongning88
2013-04-16
2013-04-24 12:12:44
by
hill200538
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MS
]
算过渡态,反应分子match后,preview出错,求解答~~~
(1/270)
翼风凌
2013-04-18
2013-04-24 08:37:45
by
枫的飘零
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MS
]
【求助】求MS 5.0中文教程
(3/1036)
Youngchsh
2011-04-15
2013-04-24 07:32:17
by
何处为归
[
LAMMPS/
]
lammps fix npt中控温控压方法
(5/5049)
jinlong8937
2013-04-21
2013-04-23 08:50:57
by
ddll_slsl
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Gromacs
]
gromacs的x2top命令用到的n2t文件请教
(0/1793)
verallqq
2013-04-23
2013-04-23 00:40:18
by
verallqq
[
MS
]
周期性和非周期性态密度的区别
(3/1489)
mikejwg
2013-04-17
2013-04-21 23:47:20
by
gzl9901
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MS
]
forcite模块 Dreiding力场的“warning”
(0/578)
upc穆宁
2013-04-21
2013-04-21 23:28:12
by
upc穆宁
[
LAMMPS/
]
请问LAMMPS是否能做流动的颗粒物质撞击的模拟?
(9/1532)
frankying
2013-04-19
2013-04-21 21:34:29
by
frankying
[
其他
]
【分享】剑桥晶体数据库CCDC完整版的
(
1
2
)
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一步一步
2010-07-05
2013-04-20 09:24:18
by
一步一步
[
其他
]
对分子模拟完全不懂?想要入门需要学习什么基础?
(3/823)
xinana2468
2013-04-19
2013-04-20 09:21:11
by
pigrass
[
MS
]
[关贴]
在MS里面用Focite优化或者用minimizer能量最小化,晶胞参数会变化吗?
(7/1806)
xiuhui
2012-04-16
2013-04-18 17:24:37
by
witchlq
[
MS
]
用ms作分子动力学模拟结果 发高因子的sci 好发吗
(
1
2
)
(13/2886)
zs806750658
2013-04-16
2013-04-17 13:46:45
by
1612
[
其他
]
为什么没有核酸三级结构预测的软件
(5/1404)
hanfei19
2012-01-01
2013-04-17 07:38:41
by
hanfei19
[
LAMMPS/
]
lammps研究范围探讨
(12/2034)
yangwenbin99
2013-04-10
2013-04-15 15:49:34
by
yangwenbin99
[
DS/Syby
]
【求助】Sybyl中-NO2 基团怎么画?
(评阅+1)
(4/1699)
bbslover
2010-12-20
2013-04-15 08:37:38
by
木鸟2012
[
其他
]
【求助】ligplot的使用
(4/1435)
shangech
2010-10-09
2013-04-12 20:22:24
by
tanxijuan
[
其他
]
PatchDock是盲对接吗
(0/929)
liuyanyanhx
2013-04-12
2013-04-12 10:39:49
by
liuyanyanhx
[
DS/Syby
]
SYBYL对接时分配原子类型后,怎样对没有分配好的原子进行手动分配?
(0/370)
liuyanyanhx
2013-04-12
2013-04-12 10:00:08
by
liuyanyanhx
[
DS/Syby
]
运行DS的电脑配置
(4/1466)
asd724210
2013-04-10
2013-04-11 19:47:20
by
鸡腿套餐
[
其他
]
[
复制
]
Mississippi State University招聘博士生
(4/200)
fegg7502
2013-04-10
2013-04-11 12:00:10
by
fegg7502
[
DS/Syby
]
精华
I
:
[关贴]
【分享】Sybyl-x v1.1.083(Linux+Windows版+数据库)
(
1
2
3
4
5
)
(评阅+8)
(47/7417)
sydtyx
2010-04-20
2013-04-10 18:08:41
by
tjchen
[
资源
]
南开大学ORIGIN使用指南
(
1
2
)
(11/2612)
红精灵
2011-06-29
2013-04-08 06:10:11
by
hnsdaa
[
Gromacs
]
gromacs模拟前,怎么样打开二硫键?打开后怎么样往上面加氢?
(0/633)
wanglang1987
2013-04-07
2013-04-07 22:54:40
by
wanglang1987
[
专家会诊
]
请教如何构建圆截面的模型
(0/377)
jinlong8937
2013-04-07
2013-04-07 17:04:20
by
jinlong8937
[
DS/Syby
]
【求助】能够计算结合自由能的分子对接软件除了autodock还有哪些?
(7/3444)
czx12czx
2010-05-06
2013-04-06 15:56:30
by
lrf1980
[
DS/Syby
]
【求助】求助:怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式?谢谢
(
1
2
)
(评阅+1)
(12/3107)
gaoqunqunl
2010-10-13
2013-04-06 11:57:55
by
jiangdafa
[
MS
]
扩散系数
(3/604)
毛头毛头
2013-04-05
2013-04-06 10:42:52
by
broken1999
[
DS/Syby
]
【求助】蛋白相互作用网络怎么画?
(
1
2
)
(评阅+1)
(14/1410)
kekexiliwolf
2010-09-20
2013-04-06 08:43:57
by
倩430
[
LAMMPS/
]
有关Lammps模拟可视化问题
(7/2067)
xiexiaojiang
2011-11-30
2013-04-05 13:15:54
by
25351048
[
DS/Syby
]
【求助】sybyl对接请教
(
1
2
)
(12/2020)
夏天的鱼
2010-08-02
2013-04-03 13:55:21
by
liuyanyanhx
[
MS
]
陈振隆
(2/574)
毛头毛头
2013-04-03
2013-04-03 11:17:58
by
毛头毛头
[
Gromacs
]
【求助】大家好,vmd能看生物分子活性吗
(评阅+1)
(7/1255)
luokei
2010-11-05
2013-04-01 14:02:08
by
gaogao2013
[
MS
]
怎样在MS中建立金属催化剂在碳载体,例如Pt/C
(7/915)
艾因死探
2013-03-29
2013-03-29 17:47:30
by
yingying1588
[
其他
]
【求助】Gromacs 并行mpi报错
(3/693)
ruthxu
2011-03-15
2013-03-29 16:33:21
by
wuhaigang
[
CPMD/CP
]
安装贴:Ubuntu 12.04(64) 并行编译CPMD3.15.3
(评阅+15)
(模拟EPI+1)
(4/2232)
ChemiAndy
2012-08-29
2013-03-28 08:36:42
by
qphll
[
MS
]
MS可以修改输出曲线的单位吗
(6/511)
jinlong8937
2013-03-23
2013-03-26 20:01:03
by
liuqiang2270
[
Monte C
]
【讨论】复合材料的导热系数能用分子模拟研究吗?
(4/900)
jzljckcxt
2010-06-14
2013-03-26 18:52:49
by
guoqiangang
[
LAMMPS/
]
自扩散系数能在平衡态统计吗?
(5/1201)
zxy2011
2013-03-24
2013-03-26 15:06:34
by
zxy2011
[
其他
]
【求助】环糊精包合物的分子模拟
(
1
2
3
)
(29/3181)
maoxiaoming
2010-06-10
2013-03-25 13:11:28
by
362254624
[
专家会诊
]
大家autodock一般都跑多久?
(4/1549)
惟精惟一
2013-03-07
2013-03-24 18:18:05
by
pymol
[
LAMMPS/
]
【求助】噻吩的分子大小
(6/1679)
lewz68
2010-06-12
2013-03-22 21:18:22
by
海阔_天空
[
MS
]
MS建模过程中遇到异常
(7/876)
xw陌上花开
2013-03-17
2013-03-21 13:53:37
by
xw陌上花开
[
Gromacs
]
请教一个问题,谢谢回复!
(7/778)
opaler
2013-02-08
2013-03-21 07:51:59
by
spirte雷
[
Gromacs
]
【求助】自由能计算,pb和gb算出来结果不一样怎么办?
(1/986)
petersen
2011-03-07
2013-03-20 12:09:35
by
rogerzhang
[
DS/Syby
]
请问我的pymol中,为何对配体(ligand)应用mesh功能无效?
(0/836)
wohaihao
2013-03-19
2013-03-19 20:21:54
by
wohaihao
[
其他
]
PCCP 投稿咨询
(5/1297)
mengyan142
2013-01-09
2013-03-19 11:12:49
by
zhou19850214
[
DS/Syby
]
Autodock Vina 对接前的预处理
(2/1257)
b247996407
2013-01-20
2013-03-18 17:54:07
by
happyqilu
[
其他
]
sybyl-x 2.0 做comfa的问题
(2/845)
iam_saving
2013-01-21
2013-03-16 21:49:42
by
iam_saving
[
MS
]
在MS分子模拟中castep模块里优化后,显示错误,但是不知道哪里错误,请赐教
(2/501)
猫头鹰love
2013-03-06
2013-03-15 17:12:19
by
qyyos
[
DS/Syby
]
怎么做受体柔性对接?
(1/682)
lin_lin_lin
2013-03-15
2013-03-15 13:10:00
by
iovvoi
[
其他
]
211硕士毕业去职校任教
(7/927)
农岚沐
2013-03-12
2013-03-15 10:33:41
by
黑色腰带
[
MS
]
碳纳米管在药物输运方面的研究
(2/381)
yahuifxlei
2013-03-14
2013-03-15 09:30:20
by
倔强的坚果墙
[
MS
]
MS为什么资料这么少
(3/448)
foreverweiyi
2013-03-12
2013-03-15 09:13:22
by
倔强的坚果墙
[
专家会诊
]
如何判断PLED性能的好坏
(3/283)
千字文
2013-03-13
2013-03-15 08:34:43
by
haixiawu
[
其他
]
高斯09编写gjf文件,文件最后留一空行有意义么?
(5/1029)
呆呆天下
2013-03-12
2013-03-15 00:14:53
by
beefly
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LAMMPS/
]
在VMD中通过不同的平面选择原子
(11/2419)
luomia
2013-03-13
2013-03-13 21:06:38
by
haixiawu
[
其他
]
[关贴]
250 —— 大学生
(27/848)
jiaoyixiong
2013-03-12
2013-03-12 15:40:31
by
xingyanfei
[
MS
]
哪位高手知道MS软件能否算水溶液中的化学反应的反应能???谢谢啊
(0/277)
qianshuiyuan
2013-03-08
2013-03-08 15:55:51
by
qianshuiyuan
[
Gromacs
]
【求助】如何计算平均滞留时间(residence time)
(评阅+1)
(7/2639)
ustbmars
2010-12-21
2013-03-07 22:05:12
by
yahoohoo
[
专家会诊
]
分子动力学模拟的小问题
(2/460)
zhanpeng1982
2013-03-07
2013-03-07 14:19:15
by
tylgd2011
[
Gromacs
]
分子模拟中,两个季铵盐正电荷基团可以被水溶液中的阴离子通过静电力拉拢到一起吗?
(14/1013)
mengsk
2012-11-25
2013-03-05 20:03:26
by
五月山药
[
专家会诊
]
Gaussian 09 参考手册出错????
(0/485)
黄金比例
2013-03-05
2013-03-05 18:56:31
by
黄金比例
[
LAMMPS/
]
用intel编译器在RHEL6.2安装lammps-17Feb12过程
(评阅+10)
(3/2076)
bs340248
2012-03-01
2013-03-05 17:45:01
by
雪藏撒哈拉
[
MS
]
castep计算过渡态时能量问题
(1/768)
hxwyy2005
2013-03-04
2013-03-04 11:02:40
by
hxwyy2005
[
专家会诊
]
用什么方法预测核苷类化合物与天然碱基形成氢键能力额强弱呢?
(0/312)
惟精惟一
2013-03-03
2013-03-03 13:34:18
by
惟精惟一
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DS/Syby
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DS做药效团的结果中的config值是什么意思?为什么我的一直降不到17?
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xxwn
2013-02-28
2013-02-28 15:47:27
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xxwn
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DS/Syby
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[关贴]
DS2.5.5 Hiphop遇到的产生多构象的问题
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yinwzi
2013-02-27
2013-02-27 15:34:18
by
yinwzi
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DS/Syby
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【求助】如何利用DS获得已知配基ligand的SD files文件?
(8/1871)
xppcomeon
2009-12-07
2013-02-27 12:54:06
by
yinwzi
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DS/Syby
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【求助】基于药效团的分子叠合
(17/3069)
sijifengsd
2010-12-17
2013-02-27 09:48:36
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高興丶
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Gromacs
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【求助】求一个gromacs的中文教程,包括安装的部分,小弟新手,从零学起
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wdali
2010-10-25
2013-02-26 19:41:51
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joy11
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MS
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大家学习MS都看过哪些文献啊~求推荐
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448112596
2012-11-08
2013-02-23 15:24:45
by
17火耳17
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其他
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春节快乐
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meixinqing
2013-02-13
2013-02-13 14:00:34
by
meixinqing
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MS
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分子动力学里的RMSD值在什么范围内说明对接结果是稳定的?
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lirenshi
2013-02-01
2013-02-01 11:54:33
by
月雨风扬
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MS
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同一个蛋白质不同的人和期刊报道的PDB编号都不一样,用哪个好呢?
(4/1660)
a-jiao
2013-01-31
2013-02-01 08:49:22
by
a-jiao
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专家会诊
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请问大神们,分子离子的电荷局域化的物理本质是什么?
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zhangpengju
2013-01-31
2013-01-31 12:07:38
by
zhangpengju
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DS/Syby
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Sybyl中,可不可以将分子随意放到蛋白质某个氨基酸残基附近?
(6/1236)
lixin240
2013-01-23
2013-01-31 09:41:05
by
qustwq
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DS/Syby
]
Make the molecular spreadsheet from all steroids in the database???问题急求
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a-jiao
2012-07-05
2013-01-31 09:00:31
by
a-jiao
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MS
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GCMC模拟气体吸附时各种吸附量该怎么求?
(5/3750)
clwl
2013-01-28
2013-01-30 20:49:44
by
原来是梦8804
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ME/Gulp
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计算声子谱 求Ge Sb Te的势函数
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pengyu_long
2011-04-05
2013-01-30 12:45:59
by
2235803
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MS
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polymer和polymer之间相互作用的计算用什么软件?
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grexx213
2013-01-29
2013-01-29 23:01:05
by
grexx213
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其他
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大家用过Stella这个软件吗?
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jaychenyl
2012-08-02
2013-01-28 07:52:32
by
songyunlong
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