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wanglang1987

铜虫 (小有名气)

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[交流] gromacs模拟前，怎么样打开二硫键？打开后怎么样往上面加氢？

如题，gromacs模拟前，怎么样打开二硫键？打开后怎么样往上面加氢？我想模拟二硫键断裂的情况，貌似这个指令可以打开：pdb2gmx -ignh -f 1AKI.pdb -o 1AKI.pdb -p 1AKI.top -water spce -ss，但是打开后怎么样加氢？pymol不识别二硫键打开，所以不能加氢？请问有什么办法吗？

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1楼 2013-04-07 22:54:40

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