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wanglang1987

铜虫 (小有名气)


[交流] gromacs模拟前,怎么样打开二硫键?打开后怎么样往上面加氢?

如题,gromacs模拟前,怎么样打开二硫键?打开后怎么样往上面加氢?我想模拟二硫键断裂的情况,貌似这个指令可以打开:pdb2gmx -ignh -f 1AKI.pdb -o 1AKI.pdb -p 1AKI.top -water spce -ss,但是打开后怎么样加氢?pymol不识别二硫键打开,所以不能加氢?请问有什么办法吗?
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