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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 用DS跑分子动力学,想购买一台workstation如下,请给意见谢谢已有7人参与

HP XW6600 工作站
标配二个至强E5405 CPU,双核2.0G ,12M缓存,1333外频,共真8核CPU
内存8G
显卡丽台FX1700专业3D图形卡PCI-E  512M显存
7200转SATA 硬盘500G。
这样的配置跑跑一般的动力学模拟可以吗?
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houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03


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linux下面还可以,比如gromacs namd等,DS-win版跑动力学个人不敢恭维
2楼2013-04-07 23:00:22
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ydc2012

捐助贵宾 (小有名气)



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E5405CPU早就停产了,主要看你预算够尽量配置高点呗,也可以考虑用Dell能便宜点,同样的价格买Dell的要比hp的配置高

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2013-04-08 16:18:22
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piaoluodeyu

金虫 (小有名气)


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cpu太老啦 效率很差的 还不如现在的四核
4楼2013-04-09 08:45:55
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yaozhq

金虫 (小有名气)


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看来是预算比较有限? 要跑动力学真心不推荐ds 用gromacs一天能跑出它10天的量来
但是你的CPU太烂了 这种配置都是服务器的入门配置 而且还是几年前的……
如果这样真不如配普通的i7高端货 单CPU的计算能力会强很多 如果还是想要双路的 至少要把CPU调高几个档次 真正干活的是CPU呀 你不多花点钱在上面算怎么回事 E5-2600系列是现在的主流产品 至于性能只能lz自己去查了 有多少钱配多好的 这里省的话 时间就省不来了
专业卡确实有一定的用处 DS显示的时候会流畅很多 不过也不用多好 除非有GPU加速的计划
硬盘就是不停的购买添加的设备 也不是主要瓶颈  暂时可以不太考虑
5楼2013-04-09 10:06:32
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wavingsea9911

木虫 (小有名气)


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显卡要那么高端有用吗?我觉得有集成的就可以了。
6楼2013-04-09 10:35:45
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guoyingnba

金虫 (小有名气)


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win下DS动力学产生的文件大小不能超多2G,2.5以及较低版本都是这样,目前就不清楚了,一致认为用DS跑动力学本身就是个不靠谱的事。
7楼2013-04-10 13:28:17
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mingzezhong

铁杆木虫 (著名写手)


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DS是比较失败的产品,建议不用DS啊,不然后悔的啊,好多免费的可以用啊,gromacs,NAMD都非常优秀
just...
8楼2013-04-27 08:19:22
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