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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢
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lrf1980

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
openbabel能将pdbqt转化成pdb么？学习了。
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11楼2013-04-04 18:50:28
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-04-08 20:21:14
直接用pymol软件打开dlg文件，然后在同一界面中打开大分子.pdbqt文件对应的pdb文件，是一种快捷的方式。。。
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12楼2013-04-05 19:07:21
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jiangdafa

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-04-08 20:21:34
analysis下，play with energy rank（大概是这意思），然后再tool menu上点击倒数第二个button，会有write current写ligand，还有write complex连着蛋白质一起保存。。。得到的file最好用第三方的软件整理一下成一般通用的pdb文件，比如openbabel
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13楼2013-04-06 14:57:55
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