应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢
52/1返回列表
查看: 3183  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

gaoqunqunl

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢

求助：有哪位大侠知道怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式吗？跪谢
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-10-13 10:35:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiangdafa

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-04-08 20:21:34
analysis下，play with energy rank（大概是这意思），然后再tool menu上点击倒数第二个button，会有write current写ligand，还有write complex连着蛋白质一起保存。。。得到的file最好用第三方的软件整理一下成一般通用的pdb文件，比如openbabel
赞一下 回复此楼
13楼2013-04-06 14:57:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

gaoqunqunl

金虫 (小有名气)
2楼2010-10-15 08:31:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yelverxm

金虫 (小有名气)
★ ★
gaoqunqunl(金币+2): 2010-10-16 12:24:55
zh1987hs(金币+2):谢谢！ 2010-10-16 13:17:43
Autodock官网有pdbqt2pdb的代码可以用啊
赞一下(1人) 回复此楼
In God we trust
3楼2010-10-16 04:25:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-10-19 16:50:55
gaoqunqunl(金币+1): 2010-10-20 10:23:39
很简单，就用打印命令，直接打印成PDF即可。
赞一下(1人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
5楼2010-10-19 15:57:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭