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张军帅

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】蛋白蛋白对接 已有7人参与

各位大侠好,谁能给推荐一下比较好用的蛋白质蛋白质对接程序,如果是在线的更好
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人生若只如初见
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张军帅

木虫 (正式写手)

自己顶一下
人生若只如初见
2楼2010-06-06 20:55:16
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nh13

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-08 12:09:45
Zdock好像可以,DS里有,lz可以到坛子里下载。
3楼2010-06-07 15:07:55
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piscesee

铁杆木虫 (正式写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-07 18:34:14
helix
4楼2010-06-07 16:53:48
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-06-08 12:10:03
ZDOCK    http://zlab.bu.edu/zdock/index.shtml
对学术用户免费,与RDOCK整合在Discovery Studio软件包中,分别进行对接和评分。

RDOCK    http://zlab.bu.edu/zdock/index.shtml
ZDOCK配套的评分软件,需要Charmm力场支持。

3D-DOCK    http://www.bmm.icnet.uk/docking/index.html
对学术用户免费,包含FTDOCK,MultiDock

DOT    http://www.sdsc.edu/CCMS/Papers/DOT_sc95.html
免费,图形界面

ESCHER    http://www.ddl.unimi.it/vega/index.htm
VEGA ZZ软件包中模块(见VEGA ZZ)

Gramm    http://vakser.bioinformatics.ku.edu/resources/gramm
免费,字符界面

Haddock    http://www.nmr.chem.uu.nl/haddock
完全免费

HEX    http://www.loria.fr/~ritchied/hex/
免费,图形界面

MolFit    http://www.weizmann.ac.il/Chemical_Research_Support//molfit/
免费

Monty        蛋白质-DNA对接,已停止研发,改为ESCHER
http://www.ddl.unimi.it/escherng/index.htm


Rosetta    http://graylab.jhu.edu/docking/rosetta
完全免费
转至袁曙光的科学网博客:
http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=280455
5楼2010-06-08 09:36:20
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张军帅

木虫 (正式写手)

谢谢大家哦
人生若只如初见
6楼2010-06-08 20:09:48
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xiaoshouyi

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
弱弱的问一下什么叫做学术用户?怎么才能成为学术用户?
7楼2013-01-13 16:31:45
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1185916楼: Originally posted by xiaoshouyi at 2013-01-13 16:31:45
弱弱的问一下什么叫做学术用户?怎么才能成为学术用户?

就是有学术机构邮箱的用户。。。哈哈
8楼2013-01-13 17:21:15
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方蓝雨

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
蛋自对接没什么実用仫值

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
9楼2013-01-14 13:00:24
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bigdavidzhu

铜虫 (小有名气)

非常感谢!不错
10楼2013-05-18 12:07:10
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