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张军帅木虫 (正式写手)
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ZDOCK http://zlab.bu.edu/zdock/index.shtml 对学术用户免费，与RDOCK整合在Discovery Studio软件包中，分别进行对接和评分。 RDOCK http://zlab.bu.edu/zdock/index.shtml ZDOCK配套的评分软件，需要Charmm力场支持。 3D-DOCK http://www.bmm.icnet.uk/docking/index.html 对学术用户免费，包含FTDOCK，MultiDock DOT http://www.sdsc.edu/CCMS/Papers/DOT_sc95.html 免费，图形界面 ESCHER http://www.ddl.unimi.it/vega/index.htm VEGA ZZ软件包中模块（见VEGA ZZ） Gramm http://vakser.bioinformatics.ku.edu/resources/gramm 免费，字符界面 Haddock http://www.nmr.chem.uu.nl/haddock 完全免费 HEX http://www.loria.fr/~ritchied/hex/ 免费，图形界面 MolFit http://www.weizmann.ac.il/Chemical_Research_Support//molfit/ 免费 Monty 蛋白质－DNA对接，已停止研发，改为ESCHER http://www.ddl.unimi.it/escherng/index.htm Rosetta http://graylab.jhu.edu/docking/rosetta 完全免费 转至袁曙光的科学网博客： http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=280455 |
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