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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】蛋白蛋白对接
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张军帅

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】蛋白蛋白对接 已有7人参与

各位大侠好，谁能给推荐一下比较好用的蛋白质蛋白质对接程序，如果是在线的更好
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人生若只如初见
1楼 2010-06-06 20:54:58
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-06-08 12:10:03
ZDOCK    http://zlab.bu.edu/zdock/index.shtml
对学术用户免费，与RDOCK整合在Discovery Studio软件包中，分别进行对接和评分。

RDOCK    http://zlab.bu.edu/zdock/index.shtml
ZDOCK配套的评分软件，需要Charmm力场支持。

3D-DOCK    http://www.bmm.icnet.uk/docking/index.html
对学术用户免费，包含FTDOCK，MultiDock

DOT    http://www.sdsc.edu/CCMS/Papers/DOT_sc95.html
免费，图形界面

ESCHER    http://www.ddl.unimi.it/vega/index.htm
VEGA ZZ软件包中模块（见VEGA ZZ）

Gramm    http://vakser.bioinformatics.ku.edu/resources/gramm
免费，字符界面

Haddock    http://www.nmr.chem.uu.nl/haddock
完全免费

HEX    http://www.loria.fr/~ritchied/hex/
免费，图形界面

MolFit    http://www.weizmann.ac.il/Chemical_Research_Support//molfit/
免费

Monty        蛋白质－DNA对接，已停止研发，改为ESCHER
http://www.ddl.unimi.it/escherng/index.htm


Rosetta    http://graylab.jhu.edu/docking/rosetta
完全免费
转至袁曙光的科学网博客：
http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=280455
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5楼2010-06-08 09:36:20
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nh13

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-08 12:09:45
Zdock好像可以，DS里有，lz可以到坛子里下载。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-06-07 15:07:55
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张军帅

木虫 (正式写手)
谢谢大家哦
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人生若只如初见
6楼2010-06-08 20:09:48
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xiaoshouyi

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
弱弱的问一下什么叫做学术用户？怎么才能成为学术用户?
赞一下 回复此楼
7楼2013-01-13 16:31:45
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