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新虫 (初入文坛)


[交流] gromacs的x2top命令用到的n2t文件请教

请问一下,有人遇到过使用gromacs的x2top命令时候,对于n2t文件中定义的原子不能正确识别的情况么?
如-OH和-COOH中的H原子。n2t中定义:
H        H1        0.45        1.008        1        O        0.0960        ;-COOH
H        H2        0.418        1.008        1        O        0.12        ;-OH
x2top之后全部识别为H1,即使故意加大-OH中OH键长,也是识别不出H2。
谢谢啦!
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