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astringent铜虫 (著名写手)
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[求助]
gromacs 中mdrun命令
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初学gmx，最近刚学gromacs，我想安装并行版的gromacs，我的gmx版本是4.5.5但是因为对程序不太懂，自己也不知道现在安装好的是不是并行版的。当我用mdrun -v -s xxx.tpr -deffnm em程序不运行，说是gmx自动开始用2threads，并提示说可以自己指定-nt，我就把命令改成了mdrun -v -nt 1 -s xxx.tpr -deffnm em（我想把-nt 生成1 就相当于串行吧。因为之前编译成串行的时候，可以进行mdrun） 这样就可以做了。我的问题是，我这样做可以吗？对模拟结果有没有影响。 请大家指点，不甚感激。 |
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