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alman001

铜虫 (小有名气)

[求助] 菌液PCR条带大小总是和连接片段不一致啊!已有3人参与

本人利用clontech的genome walker universal kit扩增一个基因的5'启动子序列,扩增出了800bp-3000bp大小不一的各种条带,然后切胶回收,连接到pMD19-T载体,转化大肠杆菌DH5a,之后挑单克隆做菌液PCR(用的是通用引物M13-F/R)。

问题来了:
                 我的菌液PCR分三种情况:a. 800bp的插入片段,菌液P出来还是800bp左右,这个比较正常
                                                          b.1000bp的插入片段,菌液P出来也是800bp左右,不正常
                                                          c.2000bp的插入片段,菌液P出来也是800bp左右,不正常
       然后我把三种情况的菌液各挑出来3个去测序,发现三种情况之间测出来的结果一致性还比较高,为什么不同大小的片段P出来的条带大小都变小??但是测序结果却比较相似,两者有什么联系吗???


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有事做,无事争
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alman001

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 王希望 at 2015-07-02 15:29:30
你每切割条带时候换一个刀片试试

有思路!
有事做,无事争
4楼2015-07-03 09:36:50
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