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紫玉涵轩

铜虫 (小有名气)

[求助] 质粒分别酶切均有正确条带,但双酶切只有一条条带,这是怎么回事?已有3人参与

我的片段长度为5400bp左右,连接到POK12载体,载体长度为2400bp。由于长片段连接太难,所以我将片段一分为二,分别为3200bp和2600bp。分别连接入pok中。再将两段连接起来。经PCR鉴定为阳性的菌液提取质粒进行酶切鉴定。片段1的双酶切为MluI和NdeI,片段2的双酶切为NdeI和EcoRV;同时使用MluI和EcoRV对整个片段进行酶切。第一行为片段1的双酶切,第二行为片段2的双酶切,均有目的条带,第三行为整个片段的酶切,但是没有pok质粒条带,只有单一的一条带,三个酶切使用的是同一个质粒,请问这是怎么回事?我到底是连上了还是没连上啊……请大家帮忙看一下分析一下其中的问题。Marker从上到下的大小为5000,3000,2000,1500,800,500,300

质粒分别酶切均有正确条带,但双酶切只有一条条带,这是怎么回事?
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lomis

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-03-19 15:31:26
Double Digest Recommendations for MluI + NdeI:
Digest in NEBuffer 3.1 at 37°C.

如果用NEB的酶,以后双酶切,先在以下网站找用哪个buffer.
http://international.neb.com/too ... ouble-digest-finder

如果换成Fermentas的酶,是只有一个buffer的,就不用担心双酶切buffer不合适。
没有命运,只有选择!
5楼2015-03-19 11:25:35
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