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龙开聪

金虫 (小有名气)


[交流] 十万火急,重组质粒酶切只有一条带,测序有结果,但反复说我质粒浓度很低

我使用的载体是Pet-32a(+),宿主菌是BL21(DE3),连接上目的基因后,提取重组质粒进行双酶切,30微升体系,酶切能看到两个条带,但目的基因被切下的条带很淡很淡,送出去测序,结果正确,但发送的报告反复说我质粒浓度很低,我进行表达后,确实表达量很不理想,用改目的基因连接到pcDNA3.1(+)上后,转化JM109,重新提取质粒,酶切使用了30微升体系,只看到载体的条带,使用了60微升体系后,目的基因的条带任然非常淡,近乎看不见,送重组菌出去测序,正反两个方向测序,却只有正一个方向有结果,表明我目的基因是连接上去了,但另一个方向测序却无结果,报告说质粒浓度太低,目的基因片段1100,测序公司为北京诺赛。求高手指点迷津,为何我质粒浓度这么低,导致酶切看不见双条带,原核表达量极低?
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
lz诱导表达的条件可以考虑修改一下~

葡萄糖是不是会一直pet系列载体的表达呢?
2楼2012-04-10 08:43:23
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龙开聪

金虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaohq1209 at 2012-04-10 08:43:23:
lz诱导表达的条件可以考虑修改一下~

葡萄糖是不是会一直pet系列载体的表达呢?

我用50ml诱导表达 没有目的条带,没办法,加到500ML才看到目的条带,体积太大,我不好优化,关键我觉得可能是我质粒浓度低,所以表达量极低,不知如何解决啊
3楼2012-04-10 08:55:36
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龙开聪

金虫 (小有名气)


我想在LB平板上加葡萄糖试试,但不知道LB平板是不是只加葡萄糖,那加不加氨苄呢,还是一起加?
4楼2012-04-10 08:57:18
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srlee

铁杆木虫 (小有名气)


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龙开聪: 金币+7, 谢谢,这两天做实验去了,都没空登陆论坛,建议不错,受益不浅 2012-04-12 17:03:32
看来LZ很纠结这个质粒浓度低,呵呵!
1)从你表述的来看,片段是连上了pET32了,测序结果也是正确的,酶切条带的亮弱直接与你提取的质粒浓度有关系,好像与酶切体系没多大关系。
2)试验中我也感觉pET系列载体copy数确实不太高,好像是中等拷贝吧,只好加大提取质粒的菌量了,从而提高质粒的浓度。
3)另外你用的BL21(DE3)是表达蛋白的宿主菌,如果你换用克隆表达宿主菌XL-1 blue或DH5a来提取质粒也许量就会多一些了。
祝实验顺利!

[ Last edited by srlee on 2012-4-11 at 12:49 ]
5楼2012-04-10 22:17:34
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dnaxxx

至尊木虫 (小有名气)


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龙开聪: 金币+3, 我表达用的是BL21,但表达量不高 2012-04-12 17:06:27
pET系列载体没有使用DH5a进行表达的吧,缺乏T7 RNA聚合酶。
6楼2012-04-11 09:39:39
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zx6291

铜虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★
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龙开聪: 金币+3, 表达的时候我诱导了,终浓度为1mM,但表达量低,我用了500mL电泳才可见目的条带,所以不好优化条件 2012-04-12 17:08:41
用IPTG诱导表达一下吧,在OD600在 0.6-0.8时候加入.
7楼2012-04-11 11:02:21
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wanglei512

金虫 (正式写手)


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龙开聪: 金币+7, 嗯,我去试试,但我真核表达载体转化到JM109克隆菌,酶切条带还是不清晰 2012-04-12 17:05:21
引用回帖:
5楼: Originally posted by srlee at 2012-04-10 22:17:34:
看来LZ很纠结这个质粒浓度低,呵呵!
1)从你表述的来看,片段是连上了pET32了,测序结果也是正确的,酶切条带的亮弱直接与你提取的质粒浓度有关系,好像与酶切体系没多大关系。
2)试验中我也感觉pET系列载体c ...

把质粒重新在DH5@中转化一下,提取质粒后酶切效果很好,我以前也遇到过,这样做了效果很好
8楼2012-04-11 16:40:59
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qqwang8706

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主你再做个平板塞选吧~!还是氨苄平板 挑单个菌落再弄一下!
9楼2012-04-11 20:34:40
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desheng101

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看楼主哭的这么伤心,赶紧来大虾帮帮楼主吧,我是来打酱油的,楼主别建议

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10楼2012-04-11 21:29:05
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龙开聪

金虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
10楼: Originally posted by desheng101 at 2012-04-11 21:29:05:
看楼主哭的这么伤心,赶紧来大虾帮帮楼主吧,我是来打酱油的,楼主别建议

做实验真痛苦啊,真羡慕文科生
11楼2012-04-12 17:10:19
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desheng101

木虫 (正式写手)



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引用回帖:
11楼: Originally posted by 龙开聪 at 2012-04-12 17:10:19:
做实验真痛苦啊,真羡慕文科生

文科生写文章也头疼哦,嘿嘿,调整心态吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
12楼2012-04-12 17:58:06
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zx6291

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by zx6291 at 2012-04-11 11:02:21:
用IPTG诱导表达一下吧,在OD600在 0.6-0.8时候加入.

IPTG一般加入浓度为0-1mM,可以做个浓度梯度,我一般用0.2或0.5mM,感觉你加了1mMIPTG,浓度有点高了,IPTG多了反而会产生毒性,过尤不及啊
13楼2012-04-12 18:33:45
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M110899

金虫 (正式写手)



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楼主你好,我现在也在做载体构建,我的目的片段是IL-10,连接的也是PET-32a,后面也打算转化BL21(DE3)。最近片段和载体连接后,酶切看不到目的片段,请问你遇到过这种情况吗?
下面这张图从左到右依次为:1kb的marker,重组质粒,单切,双切,DL-1000marker。marker都是宝生物的


14楼2012-05-05 15:02:18
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永不放弃0206

银虫 (初入文坛)



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学习,最近也在做这个
15楼2013-04-09 09:44:04
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mxp2009

新虫 (初入文坛)



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不知道你用的载体有多大?若是载体:目的片段超过10:1的话,30体系双酶切下来就看不见目的条带了。
16楼2013-04-27 18:48:27
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残月如冰任方

新虫 (初入文坛)



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你好,你的问题应该解决了吧,原因找到了吗?我现在也遇到了相同的问题。我载体是PET28a与PGEX4T-2,片段大小是600与1040,质粒条带还行,但酶切就切不开,送去测序说浓度太低。怎么回事呀?
17楼2014-02-28 17:59:17
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