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sallyquan

新虫 (初入文坛)

[求助] 单酶切后出现两条距离很近的条带 已有2人参与

我最近用BamHI单酶切我的载体,跑检测胶发现切开了,只有一条带,胶回收时发现有两条距离很近的带,且靠近点样孔的带偏暗。酶切时间37℃,40min.这是怎么么回事?是没有且彻底?
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youlinglyw

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sallyquan(myprayer代发): 金币+3, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-11-19 12:18:45
可能原因如下,按照可能性依次下降排序:
1你的载体没有酶切完全,所以造成了你的电泳有两条带,一条是环形的载体,一条是线性的载体

2你的载体上存在不止一个BamHI位点,这个可能性很大,最简单的方法是把载体全序拿来瞅瞅,看
   a,本身存在不止一个BamHI位点
   b,载体本身发生了突变,需要更换载体(方法是用载体的通用引物去对载体测序)。

3你的载体切割完全,但是存在了不同的形态,这个还真的存在,但是比较少见

提供如下解决办法,按顺序试试

1酶切时间比较短,这个是通例,一般好歹切割5,6个小时.然后去看看电泳是否有两条带(也可以调整酶的浓度,增加酶量)

2查看载体序列,看是否存在多个酶切位点

3对载体进行测序,看载体是否发生了突变而生成了新的酶切位点
天行健
2楼2014-11-19 10:29:26
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zshw_001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-20 13:00:12
这样的问题,一般就是没切开,多切一段时间吧。
永远相信未知的总是美好的!
3楼2014-11-19 16:48:30
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