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无敌小莫

铜虫 (小有名气)

[求助] pet32a双酶切之后,电泳条带找不到已有3人参与

小弟本科生一枚,最近在构建一种菌,可是经过了两个月的尝试,还是没有成功,愁死了,这个是学校的一个大学生训练项目,搞了这么久还没构建出菌种,我在九月之前还要做出目的蛋白的表达,对表达蛋白的性质做出研究,才能结题,现在是愁死了,求告各位大侠给予意见。
首先,我用的是X-hol和BamHI这两个酶,目的基因在2700左右,目的基因在经过PCR之后,做37度双酶切6h能跑出目的条带。这个是确定的。但是在双酶切32a质粒之后,确实无论如何也跑不出条带。后来又做了单酶切切pet-32a质粒,但是3h之后,依旧是没有任何条带出现。(声明:32a未经酶切的质粒是跑得出来的。)今日又做了分小时单酶切,做法是每半小时去一次37度酶切样品,迅速放入65度烘箱中使其中的酶失活,共切了两个小时,却还是没有跑出任何条带,这不应该啊,刚加入酶就取样的也没跑出来,这太不合理了吧!(取样:2微升跑胶。)今天的除了没有酶切过的质粒跑出来了非常明显的条带,其余的都没跑出来,是跑胶打样太少了么?
双酶切体系:50微升
10Xbuffer tango   10微升
BamHi                   2微升
X-hol                     2微升
pet-32a质粒                      36微升(有时质粒浓度高的话也会用25微升质粒加11微升ddH2O)
37度水浴6h
单酶切体系:20微升
buffer tango      4微升
BamHI              0.5微升
32a质粒          10微升
ddH2O            5.5微升

单酶切体系:20微升
buffer tango    4微升
X-hol               0.5微升
32a质粒          10微升
ddH2O            5.5微升

另外,跑胶电压是100V 时间是40分钟 这个应该不会有什么问题吧?
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yixinyuan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 无敌小莫 at 2014-03-07 21:11:27
位点是有的,我今天又有新发现,发现单独的只有质粒放在37度水浴之后再跑胶直接就没了,两微升的质粒。...

弱弱的怀疑有没有可能质粒溶液本身就有DNAse酶污染?
6楼2014-03-07 22:40:56
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蒙古狐狸

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-08 17:41:42
确定一下你整个酶切体系中可能每个环节都有可能污染DNA酶污染,建议;
1.换新购的酶;
2.重新高压灭菌水;
8楼2014-03-08 09:17:49
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普通回帖

youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
无敌小莫(kx444555代发): 金币+3, 鼓励交流 2014-03-07 09:41:30
个人觉得你的酶可能出问题了

你可以做以下尝试

将酶切的质粒和不酶切的质粒同条件处理(6小时,温度)

然后去检测

2 按时间酶切,分别酶切15分钟,30分钟,1小时,2小时,电泳
天行健
2楼2014-03-06 22:46:22
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无敌小莫

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-03-06 22:46:22
个人觉得你的酶可能出问题了

你可以做以下尝试

将酶切的质粒和不酶切的质粒同条件处理(6小时,温度)

然后去检测

2 按时间酶切,分别酶切15分钟,30分钟,1小时,2小时,电泳

我之前也做过对照了,只是没有同等条件处理,是将提出来的质粒,和酶切后的同时跑胶,结果是酶切后的没跑出来。还有,如果酶出了问题,那目的基因又是怎么会切出来呢?你说的第二个 我明天再做下。
3楼2014-03-06 22:53:01
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-07 09:41:35
换个新酶试试吧,单酶切双酶切都没有出带,再一个你的质粒确定是32a并且有这几个酶切位点。
hehe
4楼2014-03-07 08:14:46
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无敌小莫

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-03-07 08:14:46
换个新酶试试吧,单酶切双酶切都没有出带,再一个你的质粒确定是32a并且有这几个酶切位点。

位点是有的,我今天又有新发现,发现单独的只有质粒放在37度水浴之后再跑胶直接就没了,两微升的质粒。
5楼2014-03-07 21:11:27
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无敌小莫

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yixinyuan at 2014-03-07 22:40:56
弱弱的怀疑有没有可能质粒溶液本身就有DNAse酶污染?...

我的质粒本身是能跑出来的哎
7楼2014-03-07 22:43:18
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无敌小莫

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yixinyuan at 2014-03-07 22:40:56
弱弱的怀疑有没有可能质粒溶液本身就有DNAse酶污染?...

请问一下 ,我该如何避免这个DNAse酶污染,现在确定了是质粒的问题
9楼2014-03-08 22:20:59
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无敌小莫

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yixinyuan at 2014-03-07 22:40:56
弱弱的怀疑有没有可能质粒溶液本身就有DNAse酶污染?...

还有 顺便说下 这个奖励金币是怎么给的啊 是要我点击什么给你么
10楼2014-03-08 22:22:13
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