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bla2009

铜虫 (小有名气)

[求助] 质粒单酶切出现两条带

我的质粒是pGBKT7, 上面有EcoRI, BamHI,两个酶切位点,我分别单酶切,却跑出了两条带;另外这两个酶切位点是挨着的,中间只隔了几个碱基,可是我用这两个酶进行双酶切,却也跑出了两条带,这是怎么回事啊,高手请赐教。
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等笨笨
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liby

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-04-29 23:42:11
bla2009(金币+1): 2011-05-05 08:35:21
是不是根本没有切开,
2楼2011-04-29 17:12:31
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bla2009

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by liby at 2011-04-29 17:12:31:
是不是根本没有切开,

应该不会啊,因为有时候条带正常,有时候又不正常
等笨笨
3楼2011-04-29 18:02:18
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zlu520

至尊木虫 (职业作家)

限制人

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-04-29 23:41:55
bla2009(金币+1): 2011-05-05 08:35:43
同时用两种酶酶切时应该控制好两种酶的最适合pH,否则酶切会不完全的。或则分别酶切。
无完人!
4楼2011-04-29 19:03:36
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郝钊

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4): 很有可能~ 2011-04-29 23:39:56
bla2009(金币+1): 2011-05-01 18:36:55
是不是除了你知道的这个酶切位点,在其他位置还有同样的酶切位点啊?或者酶切不彻底,没有完全切开,一条带是线性的,另一条是超螺旋的。
5楼2011-04-29 19:29:30
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-04-29 23:42:28
bla2009(金币+1): 2011-05-04 23:20:21
1:看看你的这个载体上面到底有几个EcoRI 和BamHI酶切位点;
2:按照你说的,两个酶,各单酶切居然有两条带,说明载体上这两个酶切位点各有两个;
3:你后面又说双酶切也是两条带,我感觉又有些矛盾了

所以你先看看质粒的图谱。。。
能不能将你的电泳图传上来看看呢?
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
6楼2011-04-29 22:13:57
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5): good 2011-04-30 09:12:32
前几楼说得有道理,酶切不完全话,就会出现单链、超螺旋,甚至开环的带。
不知你的质粒是否连了外源片段,连了的话也要检查下它的酶切位点。
双酶切一定要注意,不能选用离得太近的两个酶切位点,因为酶需要一定的空间,离得太近了切不好。一般要隔10多个bp以上。
7楼2011-04-29 23:46:53
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xiaoweiwei121

荣誉版主 (文坛精英)

这潭水蓝的深邃

优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+6, EPI+1): 非常专业,非常辛苦,非常热心! 2011-04-30 09:13:17
你贴出电泳图把,不然啥也说明不了
给你做了个质粒图谱,以后你最好把你的图谱也弄出来

从上边可以看出,这两个酶都是只有一个单一的酶切位点
酶切不完全的可能性很大
8楼2011-04-30 04:36:43
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xiaoweiwei121

荣誉版主 (文坛精英)

这潭水蓝的深邃

优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

不过说实话,EcoRI, BamHI,这两个酶这么强大,说他们不完全酶切,我都不大相信
呵呵,贴图之后再说
9楼2011-04-30 04:44:48
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bla2009

铜虫 (小有名气)

谢谢7楼帮我做的质粒图以及大家热心的解答。下面的就是我做的图,
第一张左边是用EcoRI单酶切的,条带正常,右边是用EcoRI和BamHI双酶切的,两个酶之间只隔了10bp 却出现了两条带。
第二张左边是用EcoRI单酶切,右边是用BamHI双酶切的,其中3应该是还没有切开,但是5我就很纳闷。
第三张也是用用EcoRI和BamHI双酶切的,也出现了两条带。





等笨笨
10楼2011-04-30 10:55:16
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