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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 求双酶切连接、载体构建等信息~ 已有2人参与

最近学习双酶切,但太泛了,完全没有头绪,如何在引物两端加酶切位点也一头雾水,如何选择载体?如何构建载体??等等
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-01-02 12:09:28
永远一片天: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-03 21:52:51
双酶切不应该觉得太麻烦,就是把两种酶在合适的Buffer里工作就可以了。引物前加酶切位点也很好弄,把自己需要用的酶切序列添加到引物前段保证引物匹配序列不低于15bp就好。同时在酶切位点前加几个保护碱基。载体选择根据你的需要定,有合适的酶切位点。构建也一样根据需要。
hehe
2楼2014-01-02 08:57:09
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sxxuan

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-01-02 12:09:35
永远一片天: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-03 21:53:01
你可以看看pET原核表达手册,里面讲了很多理论知识,虽然主要是原核表达载体方面的构建,但也可以满足你的需求。
另外不知道你做双酶切构建载体是用于哪一方面,所以是不能具体地和你讲怎么做到。不管怎样,选择酶切位点或者载体构建,都是和你的实验目的以及序列相关。酶切位点不能是目的序列里面有的,做上下游加入酶切位点的方向要与载体的方向一致。
很多酶的厂家,例如takara/neb/fermentas等网站上都有相关的技术手册,可以参考。
你的日子如何,你的力量也必如何!
3楼2014-01-02 09:28:36
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永远一片天

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-02 08:57:09
双酶切不应该觉得太麻烦,就是把两种酶在合适的Buffer里工作就可以了。引物前加酶切位点也很好弄,把自己需要用的酶切序列添加到引物前段保证引物匹配序列不低于15bp就好。同时在酶切位点前加几个保护碱基。载体选择 ...

你好,我想请问一下如何在引物两端加保护碱基呢?酶切位点的两端都加吗?网上有许多保护碱基 的汇总,但不知道是否可靠?
4楼2014-01-03 21:59:51
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永远一片天

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sxxuan at 2014-01-02 09:28:36
你可以看看pET原核表达手册,里面讲了很多理论知识,虽然主要是原核表达载体方面的构建,但也可以满足你的需求。
另外不知道你做双酶切构建载体是用于哪一方面,所以是不能具体地和你讲怎么做到。不管怎样,选择酶 ...

想问一下如何在引物两端加入保护碱基?
5楼2014-01-03 22:00:16
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
永远一片天: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-06 19:59:51
引用回帖:
4楼: Originally posted by 永远一片天 at 2014-01-03 21:59:51
你好,我想请问一下如何在引物两端加保护碱基呢?酶切位点的两端都加吗?网上有许多保护碱基 的汇总,但不知道是否可靠?...

这个没什么要求只要不形成明显的二级结构就可以,根据引物的GC含量高了就加at多一些,低了就加一些GC
hehe
6楼2014-01-04 09:11:28
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sxxuan

金虫 (著名写手)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-01-29 17:39:50
引用回帖:
5楼: Originally posted by 永远一片天 at 2014-01-03 22:00:16
想问一下如何在引物两端加入保护碱基?...

网上有个表是关于怎么添加保护碱基的,不同酶切位点选择不同的保护碱基有利于增加酶切效率。上网一搜就出来了。然后设计引物的时候分别在酶切位点前面增加就好

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

你的日子如何,你的力量也必如何!
7楼2014-01-06 14:10:05
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永远一片天

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by sxxuan at 2014-01-06 14:10:05
网上有个表是关于怎么添加保护碱基的,不同酶切位点选择不同的保护碱基有利于增加酶切效率。上网一搜就出来了。然后设计引物的时候分别在酶切位点前面增加就好...

8楼2014-01-06 20:00:11
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wangguosing

金虫 (正式写手)

学习

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2014-01-07 07:48:45
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荆棘鸟001

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 永远一片天 at 2014-01-03 22:00:16
想问一下如何在引物两端加入保护碱基?...

可以参考如下连接中的信息
http://wenku.baidu.com/view/ffa88b52f01dc281e53af070.html
hehe
10楼2014-01-07 08:11:29
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