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wwm2008505

金虫 (小有名气)

[求助] 双酶切之后,线状质粒的连接问题

我想把一个34bp的DNA片段和一个经过酶切后的质粒(已经成线状了),设计的时候他们有粘性末端,然后用T4连接酶4度过夜连接,载体和插入片段mol比是1:5,再转化到感受态细胞中,涂平板。长出来的菌落很少,挑了之后摇菌,时间长才变浑浊。再做菌液PCR没有看到检测的条带。求助,是哪一步不对,或者是需要改进的
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sarah-miao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
LS很对哈,你才34bp那么小的片段不需要做连接加上的,直接把目的序列加在引物上,做PCR连上就好了,你这样太麻烦了呢

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8楼2012-12-04 21:49:11
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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wwm2008505: 金币+5 2012-12-09 15:06:13
gyesang: 金币+1, 建议中肯 2012-12-09 17:15:05
连接片段分子量小,分子运动比大分子快,与比它大很多的载体连接起来不容易,可以适当降低连接温度。
5楼2012-12-04 15:11:07
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带刺毛毛虫

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wwm2008505: 金币+5 2012-12-09 15:06:24
连接产物电转转化效率高些,感受态的转化效率也是个很重要的影响因素
加油
6楼2012-12-04 16:28:02
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huoyongting

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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wwm2008505: 金币+5, 有帮助 2012-12-09 15:06:33
才34bp,你直接用PCR的方法,把目的片段加在引物上,PCR扩增整个质粒,成功率非常高的,我前几天还做了一次,测序正确

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7楼2012-12-04 17:13:48
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-07 16:31:53
如果长得菌很少,应该是没有连上。一般短片段的摩尔量不好估计,非常容易多,你把插入片段的浓度降一个数量级,可能就连上了。
9楼2012-12-07 12:49:12
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普通回帖

ls1988121

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-07 16:31:29
wwm2008505: 金币+5, 有帮助, 谢谢解答 2012-12-09 15:05:44
质粒是单酶切还是双酶切?
如果是单酶切必须去磷酸化处理防止自连。
如果是双酶切,T4这一套是否有效,别人是否用过,因为buffer里含ATP,若buffer失效也会导致连接失败。
另外,也可能是PCR的问题,是否做了阳性和阴性对照。

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2楼2012-12-04 10:52:16
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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wwm2008505: 金币+5, 有帮助 2012-12-09 15:05:54
楼主为什么把这么短的序列直接设计在引物里面做overlap PCR啊,比你做链接转化效率应该高多了
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2012-12-04 11:29:36
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xj0311

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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wwm2008505: 金币+5 2012-12-09 15:06:01
你可以按照T4连接酶的说明书进行操作,16度 半小时就可以,再有连接摩尔浓度比1:3比较合适,个人建议
4楼2012-12-04 13:37:40
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wwm2008505

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by huoyongting at 2012-12-04 17:13:48
才34bp,你直接用PCR的方法,把目的片段加在引物上,PCR扩增整个质粒,成功率非常高的,我前几天还做了一次,测序正确

可以详细说一下吗。非常感谢
10楼2012-12-09 15:10:53
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