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samqueenw

银虫 (初入文坛)

[求助] 融合蛋白表达只出现前半部分蛋白条带 已有4人参与

最近做融合蛋白,pet21a做载体,融合21kd和28kd的蛋白
构建后的载体经测序没有问题,前边21KD蛋白的终止密码子已经被去除,但是表达诱导后SDS凝胶电泳只在21KD的位置有表达条带(表达条件:37度;分别试了OD600=0.5,0.7,1.0; IPTG终浓度为0.3,0.5,1.0mM;诱导1h,3h,过夜。最后发现只要诱导过夜,就会有出现表达条带)
请各位做过融合蛋白的高手赐教啊
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懂得真少
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chlorella409

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2014-01-29 16:26:29
一个载体表达两个蛋白本来就很难的,你两个蛋白基因中间有没有再加个核糖体结合位点的基因
4楼2013-12-13 08:41:07
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

【答案】应助回帖

★ ★ ★
samqueenw(kx444555代发): 金币+3, 鼓励交流 2013-12-20 15:26:26
楼主这种情况我也遇到过,以下是我的经验,希望对你能有帮助:
我有一个蛋白怎么表达都不溶,没有办法了只好做了个融合蛋白,N端的是可溶的标签蛋白
但是IPTG诱导表达的结果是只看到了对应于融合的N端的可溶标签蛋白有很强诱导条带, 融合蛋白的全长条带很弱或者几乎看不到. 用N端his-tag做纯化可以拿到混合物,其中对应于前半部分的条带明显比对应于融合蛋白全长的条带要深
我把全长融合蛋白用HPLC分离出来, 然后用酶把融合蛋白从中间切开,结果后半部分就全部都沉淀了,上清夜里只有前半部分
我推测是因为融合蛋白的后半部分本身不能正确折叠, 所以e.coli.的某种机制就会倾向于把折叠和溶解度特别好的前半部分切下来. 而且对于融合蛋白来说, 两个融合部分的连接处本来也没有结构,也容易被各种蛋白酶非特异性地切开
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
6楼2013-12-20 03:42:31
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普通回帖

samqueenw

银虫 (初入文坛)

懂得真少
2楼2013-12-05 13:12:33
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samqueenw

银虫 (初入文坛)

没人来么
懂得真少
3楼2013-12-13 08:33:25
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samqueenw

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by chlorella409 at 2013-12-13 08:41:07
一个载体表达两个蛋白本来就很难的,你两个蛋白基因中间有没有再加个核糖体结合位点的基因

那个是啥?不懂啊,能帮助完整表达么
懂得真少
5楼2013-12-19 21:24:08
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Allen206

银虫 (小有名气)

21  28哪个是目的哪个是标签?是什么标签?
不想说什么,,,,
7楼2013-12-20 09:44:24
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15879003030

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

6楼似乎有一点道i理,实在不行楼主可以考虑换载体
8楼2013-12-20 10:28:59
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b6122

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2013-12-19 14:42:31
楼主这种情况我也遇到过,以下是我的经验,希望对你能有帮助:
我有一个蛋白怎么表达都不溶,没有办法了只好做了个融合蛋白,N端的是可溶的标签蛋白
但是IPTG诱导表达的结果是只看到了对应于融合的N端的可溶标签蛋白有 ...

遇到过类似的情况。我觉得可能后半部疏水性太强,直接不表达了。楼主检查一下包涵体看是不是完整的蛋白不溶。

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2013-12-20 11:22:39
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chlorella409

木虫 (正式写手)

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-20 15:26:34
引用回帖:
5楼: Originally posted by samqueenw at 2013-12-19 21:24:08
那个是啥?不懂啊,能帮助完整表达么...

我理解为你要在一个载体上表达两个蛋白,所以要翻译第二个蛋白要在第二个蛋白前结合一个核糖体上去,看到你把第一个蛋白后面的终止子去除了,我理解为你要将两个蛋白连接起来表达为一个蛋白,这种情况下第二个蛋白没有表达出来很常见,因为融合蛋白太长翻译中间丢失了
10楼2013-12-20 13:00:13
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