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汕头大学海洋科学接受调剂
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三爷111

金虫 (小有名气)

[求助] 求问CHIP引物设计 已有1人参与

最近想做一个CHIP实验,但实验室人都没有做过,想请问下怎么设计引物。我想检测一个转录因子是否结合在某个基因的启动子上。请问设计针对该基因启动子的引物的话,要针对那一段设计?求大神指点,越详细越好!谢谢!
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三爷111

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-06-30 11:14:48
我们可以做,5500元一个样  包括设计引物  抗体不包括

谢谢,想自己做。总是要学的。
3楼2015-06-30 21:03:36
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查看全部 4 个回答

小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪

我们可以做,5500元一个样  包括设计引物  抗体不包括
生命还需要奇迹来衬托
2楼2015-06-30 11:14:48
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timmy1028

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
三爷111: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-08-08 14:51:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by 三爷111 at 2015-06-30 21:03:36
谢谢,想自己做。总是要学的。...

方法1:在UCSC browser上查你的gene,然后找到转录起始位点(TSS),然后从TSS -1500至+500的区域可认为是启动子区域,设计多对primer覆盖启动子,分别作qPCR+melting curve,从中选取合适的primer。
方法2;查文献,找validated ChIP primer
方法3: 查文献,找validated promoter sequence,然后再重复方法1
4楼2015-08-07 01:44:39
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