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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

[求助] primer 5 设计引物的问题

我想利用primer 5设计引物,已知模板序列,1kb,然后我想从这上面p出一段200bp的片段,也是已知序列,要保证200bp全部扩增出来,是不是用1kb全长进行设计啊,但是我选择不到能完整扩增我那个200bp产物的引物,求助~!!!怎么设计引物才能扩增出那短序列呢?坐等回复,谢谢大家~!
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自己选择的路,跪着也要走完!
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1949stone(金币+1): 同意 2012-02-12 19:30:40
杜拉拉314159(金币+1): 有帮助 2012-02-12 20:42:47
要扩展的200bp片段两端设计引物就好了。不用1kb的序列来设计,先把要扩展片段序列找出来。
2楼2012-02-12 19:10:08
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cxl_yll

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
杜拉拉314159(金币+1): 有帮助 2012-02-12 20:43:10
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-02-12 22:10:54
以200bp设计引物就可以了,如何需要加酶切位点,根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊
3楼2012-02-12 19:32:42
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by cxl_yll at 2012-02-12 19:32:42:
以200bp设计引物就可以了,如何需要加酶切位点,根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊

谢谢前辈,弱弱的问一下,你QQ是多少啊?我还有很多问题呢,想问问你。。。
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4楼2012-02-12 20:34:05
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by lxj341401 at 2012-02-12 19:10:08:
要扩展的200bp片段两端设计引物就好了。不用1kb的序列来设计,先把要扩展片段序列找出来。

如果用200bp的设计,能不能保证这200的片段全部扩增出来啊?我用primer5的时候,看软件界面上的图,产物只有100多bp,是不是只能合成一个短片段啊?
自己选择的路,跪着也要走完!
5楼2012-02-12 20:37:36
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 杜拉拉314159 at 2012-02-12 20:37:36:
如果用200bp的设计,能不能保证这200的片段全部扩增出来啊?我用primer5的时候,看软件界面上的图,产物只有100多bp,是不是只能合成一个短片段啊?

用200bp的序列两端设计引物,能保证这200的片段全部扩增出来的!
6楼2012-02-12 20:55:11
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钟心碧

金虫 (小有名气)

心碧

引用回帖:
6楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-02-12 20:55:11:
用200bp的序列两端设计引物,能保证这200的片段全部扩增出来的!

同意楼上!
灵魂是否存在
7楼2012-02-12 21:18:29
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

你看这个图上,是不是就是表示只合成了其中的一段啊?

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  • 2012-02-12 21:18:35, 845.7 K
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8楼2012-02-12 21:19:02
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钟心碧

金虫 (小有名气)

心碧

西瓜(金币+1): 鼓励交流 2012-02-12 22:11:15
引用回帖:
8楼: Originally posted by 杜拉拉314159 at 2012-02-12 21:19:02:
你看这个图上,是不是就是表示只合成了其中的一段啊?

是的,你要手动设计啊!才能P到2K的片段
灵魂是否存在
9楼2012-02-12 21:21:34
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by 钟心碧 at 2012-02-12 21:21:34:
是的,你要手动设计啊!才能P到2K的片段

不能用软件么?最近在学习primer5
自己选择的路,跪着也要走完!
10楼2012-02-12 21:24:56
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