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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » primer 5 设计引物的问题
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

[求助] primer 5 设计引物的问题

我想利用primer 5设计引物，已知模板序列，1kb，然后我想从这上面p出一段200bp的片段，也是已知序列，要保证200bp全部扩增出来，是不是用1kb全长进行设计啊，但是我选择不到能完整扩增我那个200bp产物的引物，求助~！！！怎么设计引物才能扩增出那短序列呢？坐等回复，谢谢大家~！
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自己选择的路，跪着也要走完！
1楼 2012-02-12 16:42:11
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1949stone(金币+1): 同意 2012-02-12 19:30:40
杜拉拉314159(金币+1): ★有帮助 2012-02-12 20:42:47
要扩展的200bp片段两端设计引物就好了。不用1kb的序列来设计，先把要扩展片段序列找出来。
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2楼2012-02-12 19:10:08
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cxl_yll

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
杜拉拉314159(金币+1): ★有帮助 2012-02-12 20:43:10
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-02-12 22:10:54
以200bp设计引物就可以了，如何需要加酶切位点，根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊
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3楼2012-02-12 19:32:42
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by cxl_yll at 2012-02-12 19:32:42:
以200bp设计引物就可以了，如何需要加酶切位点，根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊

谢谢前辈，弱弱的问一下，你QQ是多少啊？我还有很多问题呢，想问问你。。。
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自己选择的路，跪着也要走完！
4楼2012-02-12 20:34:05
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-02-12 19:10:08:
要扩展的200bp片段两端设计引物就好了。不用1kb的序列来设计，先把要扩展片段序列找出来。

如果用200bp的设计，能不能保证这200的片段全部扩增出来啊？我用primer5的时候，看软件界面上的图，产物只有100多bp，是不是只能合成一个短片段啊？
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自己选择的路，跪着也要走完！
5楼2012-02-12 20:37:36
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 杜拉拉314159 at 2012-02-12 20:37:36:
如果用200bp的设计，能不能保证这200的片段全部扩增出来啊？我用primer5的时候，看软件界面上的图，产物只有100多bp，是不是只能合成一个短片段啊？

用200bp的序列两端设计引物，能保证这200的片段全部扩增出来的！
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6楼2012-02-12 20:55:11
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钟心碧

金虫 (小有名气)

心碧
引用回帖:
6楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-02-12 20:55:11:
用200bp的序列两端设计引物，能保证这200的片段全部扩增出来的！

同意楼上！
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灵魂是否存在
7楼2012-02-12 21:18:29
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)
你看这个图上，是不是就是表示只合成了其中的一段啊？
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    • 2012-02-12 21:18:35, 845.7 K
自己选择的路，跪着也要走完！
8楼2012-02-12 21:19:02
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钟心碧

金虫 (小有名气)

心碧
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2012-02-12 22:11:15
引用回帖:
8楼: Originally posted by 杜拉拉314159 at 2012-02-12 21:19:02:
你看这个图上，是不是就是表示只合成了其中的一段啊？

是的，你要手动设计啊！才能P到2K的片段
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灵魂是否存在
9楼2012-02-12 21:21:34
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by 钟心碧 at 2012-02-12 21:21:34:
是的，你要手动设计啊！才能P到2K的片段

不能用软件么？最近在学习primer5
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自己选择的路，跪着也要走完！
10楼2012-02-12 21:24:56
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