应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » primer5能输入多序列么？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
71/1返回列表
查看: 2676  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看

匿名

用户注销 (正式写手)
本帖仅楼主可见

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-09-14 13:23:15
已阅   同方向广播   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

yemuren

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
dhd997(金币+4): good 2011-09-14 18:15:34
周游1166(金币+8): 很好，很强大 2011-09-15 01:41:43
wanhscn: 鼓励继续解答，将会授予专家指数！ 2011-09-15 08:20:40
wanhscn: 决定授予专家指数，见6楼！ 2011-09-16 14:28:31
特异性引物是在一条序列上设计的引物，LZ下载了很多序列是要设计简并引物？用CodeHop可以在线设计很好的简并引物。
用Primer5.0可以输入多条序列并设计引物：首先把各序列分别存储为fasta格式，再在 file-open-DNA sequence 里边把各个序列依次加入，然后点击alignment，比对完之后再点击primer，调整参数进行search或手工拉动选择引物。表现的形式是非简并性的，但是你从下边可以看得出来哪个碱基是非简并性的，然后手动调整。
赞一下(4人) 回复此楼
我的专长叫做流浪，所以我就做了流氓~
2楼2011-09-14 13:50:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongxiangquan

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励交流 2011-09-14 18:15:44
周游1166(金币+5): 2011-09-15 01:42:16
可以，导入aln文件即可，不过设计的效果一般，有专门设计通用引物的软件，去查查，具体名字忘记了
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-09-14 16:54:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
本帖仅楼主可见
赞一下
4楼2011-09-15 01:25:25
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

博杰冲

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

周游1166(金币+5): 求过程啊，呵呵。谢谢！ 2011-09-15 19:24:16
我一般都用DNAstar进行序列比对，然后再用olig6设计引物。然后再用blast进行分析引物设计的好不好使。
赞一下 回复此楼
5楼2011-09-15 08:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yemuren

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
周游1166(金币+2): 恩，等我摸索看看，谢谢！ 2011-09-15 19:24:58
wanhscn(金币+3, MolEPI+1): 根据楼主的悬赏金币数，以及解答效果，再三考虑，决定授予一个专家指数！ 2011-09-16 14:27:09
引用回帖:
4楼: Originally posted by 周游1166 at 2011-09-15 01:25:25:
你好，我的意思是，我下了很多这个属的序列，也下了其它属的序列。然后想设计这个属的特异性引物，比如尖孢炭疽菌的特异性引物一样，只能扩增尖孢炭疽菌。
这个该如何操作呢？谢谢你了，高人啊！

你下载几个和你目的菌株同一属中同种的相关序列，用clustalX比对，选取同源性高的区段，然后在这些设计引物就行了。我觉得其他属的序列就不必了，当然，如果比对发现同源性高的话也是可以的；或者你直接把下载的序列复制到CodeHop在线引物设计中去，设置好简并度，就会出来一些引物，你根据自己的需要和它提供的参数选择理想的引物就好了，这种方法比较简单。
赞一下(1人) 回复此楼
我的专长叫做流浪，所以我就做了流氓~
6楼2011-09-15 09:01:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2893519569

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dongxiangquan at 2011-09-14 16:54:05
可以，导入aln文件即可，不过设计的效果一般，有专门设计通用引物的软件，去查查，具体名字忘记了

怎样导入.aln文件，为什么我的aln文件导不进去Primer6.0啊，能不能具体的教下我
赞一下 回复此楼
7楼2018-09-09 20:46:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 周游1166 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂 +3 李广火 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:57 by 蓝云思雨
[考研] 308求调剂 +5 倘若起风了呢 2026-04-05 5/250 2026-04-05 18:17 by 啵啵啵0119
[考研] 调剂 +4 不逢春 2026-04-05 4/200 2026-04-05 18:07 by ms629
[考研] 材料调剂 +4 一样YWY 2026-04-05 4/200 2026-04-05 17:41 by wxiongid
[考研] 材料调剂 +7 dxy调剂 2026-04-04 7/350 2026-04-05 09:15 by 陌秋26
[考研] 325求调剂 +4 春风不借意 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:08 by 啵啵啵0119
[考研] 331求调剂 +3 niby 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:56 by 蓝云思雨
[考研] 359求调剂 +7 hhhhaaaa$ 2026-04-04 7/350 2026-04-04 18:49 by imissbao
[考研] 本9一志愿2 0854低分专硕286求调剂 +9 芒种111 2026-04-04 9/450 2026-04-04 11:01 by tangruihua
[考研] 322求调剂 +4 FZAC123 2026-04-03 4/200 2026-04-03 20:55 by zhq0425
[考研] 327求调剂 +9 小卡不卡. 2026-03-29 9/450 2026-04-03 19:48 by 百灵童888
[考研] 求调剂 +8 akdhjs 2026-04-03 8/400 2026-04-03 18:17 by 戴维ING
[考研] 求材料调剂 一志愿南昌大学 328分 +5 yyy..... 2026-04-03 5/250 2026-04-03 13:46 by 百灵童888
[考研] 生物学硕341求调剂 +4 你笑起来像云朵 2026-04-03 4/200 2026-04-03 10:32 by macy2011
[考研] 一志愿安徽大学0817化学工程与技术，求调剂 +14 我不是只因 2026-04-02 15/750 2026-04-03 09:49 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿山东大学，085600，344 +7 魏子per 2026-04-02 8/400 2026-04-02 21:12 by 百灵童888
[论文投稿] chinese chemical letters英文版投稿求助 120+4 Yishengeryi 2026-03-30 6/300 2026-04-02 17:19 by Yishengeryi
[考研] 一志愿北京科技大学材料学硕328分求调剂 +6 1段时间 2026-03-31 7/350 2026-04-02 13:57 by 3041
[硕博家园] 考研调剂 +5 骆驼男人 2026-04-01 5/250 2026-04-01 14:28 by syjjj0321
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭