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yemuren

铁杆木虫 (正式写手)

MolEPI: 3
应助: 0 (幼儿园)
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性别: GG
专业: 生物大分子结构与功能

【答案】应助回帖

★ ★ ★
周游1166(金币+2): 恩，等我摸索看看，谢谢！ 2011-09-15 19:24:58
wanhscn(金币+3, MolEPI+1): 根据楼主的悬赏金币数，以及解答效果，再三考虑，决定授予一个专家指数！ 2011-09-16 14:27:09

引用回帖:

4楼: Originally posted by 周游1166 at 2011-09-15 01:25:25:
你好，我的意思是，我下了很多这个属的序列，也下了其它属的序列。然后想设计这个属的特异性引物，比如尖孢炭疽菌的特异性引物一样，只能扩增尖孢炭疽菌。
这个该如何操作呢？谢谢你了，高人啊！

你下载几个和你目的菌株同一属中同种的相关序列，用clustalX比对，选取同源性高的区段，然后在这些设计引物就行了。我觉得其他属的序列就不必了，当然，如果比对发现同源性高的话也是可以的；或者你直接把下载的序列复制到CodeHop在线引物设计中去，设置好简并度，就会出来一些引物，你根据自己的需要和它提供的参数选择理想的引物就好了，这种方法比较简单。