应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于pcr引物设计的问题
71/1返回列表
查看: 1618  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

萨鲁曼

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于pcr引物设计的问题

老师让我设计PCR的引物，老师让我利用《T-DNA Primer Design 》这个网站或是Primer PREMIER 5设计.想问一下这两个设计出来的有什么区别吗？我的材料是杨树cDNA，有什么需要特别注意的吗？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

淘贴分享

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
赶紧毕业！
1楼 2012-08-20 18:16:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
萨鲁曼: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-08-26 09:13:53
具体区别可能要看相关文献了吧。
一般引物设计考虑退火温度啥的。
具体哪个好，还要看实验结果了，生物信息软件只是提供一个方向，或者说是一个假设，需要实验来验证的
赞一下 回复此楼
2楼2012-08-21 05:18:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主
T-DNA   http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html
Premier   http://www.ibioo.com/soft/biosoft/2009/7310.html

[ Last edited by wizardfan on 2012-8-21 at 05:23 ]
赞一下 回复此楼
3楼2012-08-21 05:21:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

real-gold

银虫 (小有名气)
T-DNA   这网站怎么使用？
赞一下 回复此楼
4楼2012-08-21 15:07:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

荒原苦行僧

铜虫 (小有名气)
★ ★
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖！ 2012-08-22 20:09:34
我也不知道区别大不大，以前做毕业设计的时候用过Primer PREMIER 5，我记得设计引物的时候需要知道你的目的基因的片段，能得到很多对引物，但大多数都是不能用，软件本身可以帮你排除一部分，剩下的只能你自己去分析或者做实验。我们那会引物都是买来直接用的，设计的过程就是走个过场……
赞一下 回复此楼
5楼2012-08-21 17:33:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bioleo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你要先了解下引物设计原理，很好找的，就那几点。
然后可以用2种方法都设计下，再根据原理比较下，最后还可以上NCBI进一步比对特异性。
赞一下 回复此楼
6楼2012-08-22 14:02:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sayfxxk2u

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不管用oligo，primer premier 5设计的，还是网页的，设计出的引物都是差不太多的，主要就是软件本身计算不同的，主要还是根据目的基因来设计，退火温度，二聚体啥的，一般遵照设计原则的，设计出来的都是可以的，特异性也蛮高的，实验中可以再调整退火的温度，之类的。
赞一下 回复此楼
7楼2012-08-23 15:37:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 萨鲁曼 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭