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慢慢的路过

铜虫 (初入文坛)

[求助] 菌落PCR的条带比目标基因要大 已有3人参与

最近做了菌落PCR,出现了很莫名的结果,想向大家咨询一下

图里泳道1,2都是用自己设计的引物P出来的目标基因 ,3-8是菌落PCR的结果。泳道4的是正确的目标基因,已经测过序了。

泳道5.7.8都比目标基因要大一截,我想咨询一下大家这是为什么。

菌落PCR的条带比目标基因要大
H菌落PCR 1,2参照,3-8菌落.jpg
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晞朔

金虫 (正式写手)

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1. 污染,连接了非目的片段。
2. 目的基因的可变剪切片段。
3. 目的基因核苷酸序列构象发生变化,这种情况很少。

都需要测序验证。
2楼2015-06-01 14:09:06
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calorimetry

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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扩增出比目的基因更大片段的DNA,最可能是模板不纯,或者发生了污染。最简单的处理办法,直接把电泳中纯的目的DNA的电泳带切下来,然后溶解凝胶后回收出其中的DNA,就用后者直接扩增,如果是电泳出来带显示是纯的,就不要去找什么原因了,就用此纯模板扩增就行了。
3楼2015-06-01 14:15:17
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a13515517892

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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请问你pcr扩增的引物都是一样的吗,
4楼2015-06-01 15:46:38
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